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VBM analysis

 各位老师好!
请教下关于VBM全脑体积回归的老问题,在论坛里也搜索了,如果用VBMtoolbox分析的话,会有TXT文件,将三者值相加在统计的时候回归即可,
那么用DPARSFA中的NEW SEGAMENT+ DARTEL 做的时候,我不知道怎样找到有关的这样类似的文件,只有三个分割的图像,
我需要将图像“加起来”作为mask去回归吗? 具体怎么做呢? 非常感谢老师的解答!

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從FunImg去跑一直出現錯誤

老師
為何我從FunImg去跑一直出現錯誤, 但卻可以FunRaw 開始

Generating voxel specific head motion for D:\analysis_CTL\regularup\new\RealignParameter\NL1967\rp_20121027_104943CO11LINYUEHCHINGs010a1001.txt...??? Undefined function or method 'gmdmp' for input
arguments of type 'double'.

Error in ==> y_VoxelSpecificHeadMotion at 79
Disp =
y_gmdmp(inv(M_RigidBodyTransform)*Head0.mat, 2,

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第十一届功能磁共振影像(fMRI)培训班:多模态fMRI技术及应用专题

第十一届功能磁共振影像(fMRI)培训班:多模态fMRI技术及应用专题

2014.12.11 – 12.14(中国·北京)  

 

联合主办单位: 

中国科学院生物物理研究所北京磁共振脑成像中心

中国科学院心理研究所磁共振成像研究中心

美德医疗

支持协会: 

中国认知科学学会

讲师单位: 

北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室

中国科学院生物物理研究所北京磁共振脑成像中心

杭州师范大学认知与脑疾病研究中心

中国科学院心理研究所

北京大学磁共振成像研究中心

首都医科大学宣武医院

研讨会简介

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Can ReHo analysis be used in task-related fMRI study?

Dear all,

    As the title I made, can ReHo analysis be used in task-related fMRI study? Also, is the ReHo value equal to Kendall's W (KCC)? If we use a significant region to be a ROI and extract its value, then this value is a ReHo value or KCC value? 

Your help will be greatly appreciated!

Best,

CJ 
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DPARSF预处理报错

各位老师,晚上好。
我在用DPARSFA作数据预处理的时候报错如下,然后换了DPARSF还是一样的报错。但是单独用SPM8做头动校正又可以,实在不知道是哪里出了问题。
希望老师们不吝赐教,谢谢!

然后这是我的设定

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DPARSF Advanced版本无法找到participants,手动添加也找不到,而basic能找到是怎么回事

 各位专家,我想询问下为什么刚刚下载的DPARSF来处理ProcessingDemoData,进入Advanced版就无法读取participants右键添加也找不到,而basic版能自动找到,是怎么回事呢?
数据文件按视频说的存在了F/Analysis/FunRaw
                                                     T1Raw

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使用DPARSF做任务态fMRI图像预处理报错

各位老师,大家好!
想使用DPARSF做预处理,数据是4组,每组20人,每个人有2个run。我将每个人的每个run给予独立的命名,如sub_001_run1,sub_001_run2,整理存入FunRaw。再将每个人的3dT1相数据整理存入T1Raw文件夹下对应的sub_001_run1。复制一份存入sub_001_run2。由于是任务态的数据,我只想做realign,normalize by using segment T1 ,smooth。

DPARSF中我只选择了:EPI DICOM to NIFTI,Realign,Reorient Fun*,T1 DICOM to NIFTI,Affine Regularisation in Segmentation,Normalize,smooth

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请教一下用rest做激活图的问题

已经用SPM8得到了单个被试的任务激活图,接下来想做组分析,有以下几个疑问:
1.(1)用SPM做组分析,在Results中选择FDR校正,p值选为0.05,再用slice viewer打开生成的SPM_T图(是否需要在slice viewer中再设置p值?);(2)用rest做单样本t检验(base是否应为0?),再用slice viewer打开生成的nii文件,p值设置为0.05,并且在misc中选择FDR校正。
(1)和(2)两种方法是否有区别?
2.在slice viewer中得到激活图后想要保存下来用到论文中。十字架位置不同,显示的slice也不同,应如何选择十字架位置?

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