March 2012

询问

Submitted by liuweiguo1111 on Sat, 03/31/2012 - 11:00

严老师
今天用REST统计算DARTEL分割的数据时出现以下错误，不知何意，请教，我的3GB大内存已经打开了。
wc2co20101205_150356t1mpr3Dsagp2isoXUDEZHENs003a1001.nii.img
wc2co20101205_160735t1mpr3Dsagp2isoFENGGUANGYUNs003a1001.nii.img
??? Error using ==> cat
Out of memory. Type HELP MEMORY for your options.

Error in ==> rest_ttest2cov_Image at 40
DependentVolume=cat(4,DependentVolume,AllVolume);

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关于MASK，请教，十分感谢！

Submitted by Chen0075 on Sat, 03/31/2012 - 10:35

在你们的文章中写到：“The global mean ALFF value was calculated for each participant within a group GM mask obtained by selecting a threshold of 0.2 on the mean GM map of all 54 subjects. ”（Human Brain Mapping 2012）
想请问：这里的0.2是指什么值，这种设定MASK的做法是在MRIcro--ROI--Apply intensity filter to volume中做的吗?

该做法能否应用于设置WM MASK？

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caret

Submitted by ayo on Fri, 03/30/2012 - 17:44

老師,我在使用caret時,在load SCENE時,點選"Fiducial_Left"(無論任一選項)
皆會跑出,以下之文字,是因為我少安裝了什麼嗎

The following errors occurred while applying the scene:
Human.PALS_B12.RIGHT_AVG_B1-12.INFLATED.clean.73730.coord does not exist.
Human.PALS_B12.LEFT_AVG_B1-12.INFLATED.clean.73730.coord does not exist.Surface named "Human.PALS_B12.RIGHT_AVG_B1-12.INFLATED.clean.73730.coord" not found.

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AlphaSim校正的问题

Submitted by bgao on Wed, 03/28/2012 - 23:11

老师你好，我想请教的问题如下：
1. 为什么在脑的研究里，alphasim校正比FDR，FWE更合适？
2. alphasim校正时，选择不同的cluster size和p值结果会有明显的不同，我们如何知道选什么样的cluster size和p值才是合适的呢？选择p<0.001的脑区里却有着不属于p<0.005的脑区，我们如何解释这一现象呢？
3. 用alphasim校正时，我们在文章里除了报告p值外还要报告rmm的值和使用的mask吗？还有其他的吗？

非常感谢!

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请教一个相关分析的问题

Submitted by Chen0075 on Wed, 03/28/2012 - 17:29

老师，您好！
参照REST的视频讲解，我先分别做了两组被试者的组内分析（within-group analysis），然后做了“并集”计算得出一个MASK，用于2-sample t-test。得到了两组间有差异的脑区。
我的问题是：如果我继续做correlation analysis（与行为量表相关），应该是把分析的范围限定在“并集MASK”内，还是限定在存在差异的脑区？那种做法会比较好？
另外，请问SPM可以直接做correlation analysis吗？

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