December 2014

DPARSF报错

数据整理没有问题一直报错如下,是怎么回事?
??? Index exceeds matrix dimensions.

 
Error in ==> DPARSFA_run>(parfor body) at 2224
        MeanFilename =
        [AutoDataProcessParameter.DataProcessDir,filesep,'RealignParameter',filesep,AutoDataProcessParameter.SubjectID{i},filesep,DirMean(1).name];

DPARSFA回归WM,GM,CSF时生成的mask与Realign得到的图像的坐标不一致

老师:
您好!
我用DPARSFA对静息态的数据进行预处理,顺序是:SliceTiming-Realign-T1Segment-Nuisance Covariates Regression-Mormalize.遇到了两个问题:
1.我发现Nuisance Covariates Regression的时候生成的某些被试的白质、灰质、脑脊液、全脑信号mask的坐标位置与realign得到的图像的坐标位置有差异。如图(左侧为realignParameter文件夹内的图像,右侧为Masks中BrainMask图像,用MRIcro显示的同一坐标位置的截图):

经过VBM预处理和双样本t检验以后,想要利用统计出来的正负激活簇作为ROI来计算被试的这些ROI的体积,但是中间和后面出现了一系列问题

如题所示,我完全是这方面的小白,现在想要提取一些参数作为区分AD和NL,我手上只有结构型的MRI,所以用spm,rest这类工具有点茫然

现在我先是 通过VBM预处理,就是按照范丰梅写的那个《VBM处理流程-PDF》来的,经过了normalizing和segmenting,其中有的部分因为spm8和spm5有不同,所以我除了针对AD的预处理是thorough cleanup之外其他都是默认选项,比如那个high-demensional DATREL模板,最后使用了FWHM[8 8 8]的高斯平滑。

然后我选择了smwrp1*.nii这些文件用spm进行了双样本t检验,操作仍是参照范丰梅写的那个《VBM处理流程-PDF》.

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