October 2016

关于TR时间的疑问

各位老师:

       我在设置扫描序列时要获得较多的时间点又要满足信噪比,需要TR时间比较长(需要3s),这会对结果有什么影响吗?看严老师的视频只说TR时间较短会受到呼吸和脉搏的信号干扰,但不知道TR时间长除了增加扫描时间对后处理的结果会有什么影响,还请各位老师不吝指教!多谢啦

关于DPARSF数据转移报错的问题

各位老师好,有个问题想请教一下。

在使用dparsf(Basic;matlab2014a)处理数据的时候,经常会发现上一步生成的数据没有转移到相应文件夹的错误。比如某些被试第一步数据格式转换的结果,还保留在T1Raw文件夹中,没有转移到相应的T1Img文件夹中,导致在去除前10个时间点的时候报错。检查了很多遍,文件命名没有问题。想知道为何出现这样的错误,该如何解决?

希望各位老师不吝赐教。

 

 

Forums: 

关于在rest slice viewer中坐标转化的问题;

各位老师好,最近在使用rest1.8的过程中遇到了几个问题,特来请教。

我在使用rest viewer的时候发现,用talairach坐标表示的种子点,被转化为mni坐标表示的种子点后其所在脑区发生了变化。例如我想利用谋篇文献中的位于amygdala的一个种子点制作球形ROI,将其talairach坐标转换为mni坐标之后发现该种子点位于HC(原文中的t坐标为29 -2 -15,转换后的mni坐标为30 -2 -21)。

另外,在rest1.8中也可以不用rest viewer进行坐标转换,但是在FC(Fun.Connectivity)中我发现坐标转化的结果和rest viewer是不同的。还是以这个位于amygdala的种子点为例,原文中t坐标为29 -2 -15,利用FC转换之后其min坐标为32 -2 -22。

这两种转化结果应该以哪个为准?

还有,经过坐标转换之后的种子点其所在脑区发生了变化,是不是意味着得出的结果不可用?例如,假设我利用静息态数据发现该种子点的球形ROI与insul之间的功能连接与抑郁得分相关显著,那我的结论是“amygdala与insula之间的功能连接与抑郁得分相关显著”还是“HC与insula之间的功能连接与抑郁得分相关显著”?

还请各位老师不吝赐教,谢谢!

关于FC的问题,答复审稿人

各位老师,大家好,我的一篇文章大修,是研究基因型与疾病关系的。

我首先用VBM,做了基因型与组间(正常/患病)的方差分析,得到有两个cluster存在交互作用,然后用这两个cluster做全脑的FC,再做FC的方差分析

审稿人除了指出样本和效应量的问题以外,还提出“

Is there a bias for picking up ROI seeds correlated with GENE and then evaluating the relationship between GENE with the FC connected to these seed ROIs?'

不知道审稿人的这个问题怎么回答合适?多谢指教!



DPARSF提取roi时间序列的问题

尊敬的各位老师:

       我在用dparsf提取roi的时间序列,是自己定义的坐标点和半径的那种,同一个被试(之前我师姐提取过)同样的坐标和半径为什么我俩得出来的时间序列不一样?不知道是不是matlab版本的问题,就是想问这样的结果算是正常么?跪求各位老师和大神们的回答!!!

补充:均是做过预处理,并且参数也一致,我用的是advanced dparsf,她用的 basic dparsf