ALFF数据的双样本t检验的和FDR矫正的问题

 各位老师好:
我在做治疗前后组患者的ALFF的对照研究,我用治疗前组患者的ALFF图减正常组的图得到图像和治疗后组减去正常组的图像进行比较。
发现了几个问题不明白想请教下。
1) 我关心的是limbic network,DMN,executive control network这三个网络,我是应该做好这三个网络的mask,分别进行双样本t检验?还是做好双样本t检验,然后再找出这些网络的cluster进行比较?
2)关于FDR矫正,应该选多大的cluster?另外经过FDR以后,我第一组患者的p值是0.0018501,第二组是0.00021627,这样两组可以比较么?