anatomy toolbox 概率图定义感兴趣区

Submitted by wleewell on Thu, 05/31/2012 - 11:53

最近琢磨了一下SPM anatomy toolbox中的probabilistic maps定义感兴趣区功能，有如下问题想请教下老师们：
1、如果想把其中的某个脑区的probabilistic map卡到50%以上，如贺老师2011年参与的精神分裂症plos one的一篇研究中，we defined the replicable amygdala ROIs based on structural atlases from stereotaxic probabilistic maps.  A modest threshold of 50% was applied. This means that only voxels with at least a 50% probability of belonging to the amygdala were included. 怎么可以实现这一步，是否可以在rest中利用image caculater将图像卡到0.5阈值。
2、该软件中的maximum probability map，阈值是多少呢？
3、得到了anatomical MNI空间的图像，怎么转换为MNI空间？
4、The advantage of such probabilistic maps is that they provide information about the location and inter-individual variability of brain areas in standard reference. 对这段话还是有些不解，在定义感兴趣区后通过什么形式来体现个体之间ROI变异的呢？能体现个体变异的信息是什么呢？
space.
谢谢！

Submitted by YAN Chao-Gan on Fri, 06/01/2012 - 03:00

 对这个软件不太熟，试着回答一下：
1. 可以。
2. 不太了解。
3. 应该已经是在MNI空间了。
4. 我想意思是指：由于被试间存在结构变异，某个点在所有被试上都属于amygdala，那它的概率就是100%，而有的点由于被试间变异大，只在30%的被试上属于amygdala，另外70%的被试上不属于，那它的概率就是30%。

Submitted by ZHANG_RESTadmin on Fri, 06/01/2012 - 12:39

maximum probability map我记得是这样形成的：一个voxel可能属于多个prob map, 但是选最大prob的作为该voxel所属的脑区。