有关阈值的选择

老师:
      您好!
      由于我要选择我做的单样本t检验的结果做mask,在进行t检验时,请教阈值如何选择?在spm中有FWE、FDR(xjview中有这个选项)中涉及阈值的选择,我需要严格一些的结果,改如何选择呢,另外cluster的选择有没有一定的规定,一般选择多少?
      另外,用spm和rest做出的结果有些出入,我怎么选择呢?
      由于一些参数选择的不同,得到的结果有些不同,不同的结果会使最后做组间差异的结果也会不一样,这一点比较困扰我,再次请教老师您,麻烦了!

阈值的选择,只要超过要求的最低标准,如何选择是有一定任意性的。如果选择单样本t检验的结果做为mask,目的是为了进行两组之间的比较,不同的标准或参数,两组间比较的结果,的确会受影响,这个问题无法避免,我认为只要在文章中讲清楚就可以了。
"用spm和rest做出的结果有些出入",请把问题描述得再具体些。

      感谢臧老师的解答!
      关于“用spm和rest做出的结果有些出入”,是这样的:用spm做出结果在xjview里report时有三个簇,但是到了rest里就是两个簇了,还有以前做处理数据的时候有时候也会碰到这样的问题,有时候结果一样的时候,可能调的参数(比如cluster)不一样,如果参数调一样了,结果会有些不一样。
     另外,在用spm时在做”result“里FWE里限定了阈值0.001,在xjview里还能在FDR里矫正吗,可以重复选择吗。可能这几个选择阈值的意义我还有些不明白,再次麻烦老师的解答,谢谢!

用SPM和xjview结果不同,有可能是因为内在的参数选择不同。这个问题,我不专业。
对于同一个结果,肯定不能重复进行多重比较校正。比如,不能先用A方法对某个t图进行多重比较校正,之后,再用B方法在前面的基础进行校正。

 需要注意一下,采用xjview查看结果,P值默认采用的是单侧检验,而REST采用的是双侧检验。同样设定0.05, REST的T阈值要比xjview严格一些。

另外,团块的连接定义准则有可能会不一样,xjview使用SPM的边连接准则,而REST slice viewer的准则是可以通过rmm值来进行调节的。