各位老师:
我想咨询一下双样本T检验的mask问题, 我是MRI新手，我的感受是Rest软件最大的困难对我来说是每一个统计都让你选mask,而我不会制作mask，不点mask总觉得分析不规范，为此我为了mask摸索了一个月, 才敢用此软件。而SPM的分析只是点击，选默认mask。我根据严老师讲课视频和论坛中有老师写的"先用两组单样本T检验显著的脑区，在RESTimage Calculator:中根据公式(abs(i1)> threshold)+(abs(i2)> threshold)>0取他们的并集做一个mask供双样本检验用，这样小一点的mask才有可能使有些信息活下来的"这个原则，我进行了mask制作.但我不知道我做得对不对:
1. 我用DPARS算出两组各个人的smRehoMap等, 先对两组分别进行smReho-1 MAP单样本的T检验,因我没有假设,所以这步mask 我选的Rest软件自带的brain61X72X61模板作为mask(因我看文章中阳性区域报的结果太多了,尽管基底节更多一些), 然后, 单样本T检验中得到病人和对照组各自的T图,下一步,取两组T检验显著的脑区,先去看threshold value, 用RestSlice Viewer中将病人T图呈现出来, 我选择P=0.05, 得出Threshold=2.1448,又将对照组T图呈现出来, 选择P=0.05,得出Thresthold=2.093.有了threshold, 可以在Rest Image Calculator中根据公式: (abs(i1)> threshold)+(abs(i2)> threshold)>0, 输入(abs(i1)> 2.1448)+(abs(i2)> 2.093)>0, 出来的mask是个红色图(见图1,光盘映像文件，需用Rest Sliceview打开),我不知道这个过程或公式对否, abs是什么意思,是否不要加?
2. 于是, 我去掉abs, 又用(i1> 2.1448)+(i2> 2.093)>0(我看视频上为(i1>1.96+i2>1.96)>0)公式,出来的图比刚才那个图少些脑组织(见图2),不知道哪个对?
3. 最后我用第一个公式做出来的mask,作双样本T检验, 结果统计出来的下面的T图(见图3),但不知道是什么意思,这是 smReho 最后分析出来的是结果吗,我选P=0.05，cluster size=85, rmm=4,选了个图像裁了下来（见图4）?
4. 另外一个问题是如果不用大脑或灰质模板做mask的话,是否每做一个变量都要做mask,如分析mReho,ALFF, mALFF,fALFF等要按上述方法制作阳性结果并集的mask吗?
请各位能给予回复和指导,谢谢~~~~
Submitted by YAN Chao-Gan on Sat, 09/08/2012 - 07:02 Permalink
Re
你好！
不好意思，我的讲解可能有误导，我说的方法不是金标准，是有先验假设的，即你只关心在两组中任意一组显著的脑区中去寻找差异。
如果拒绝这个假设，在组内各自都不显著的区域，也有可能会存在显著组间差异的可能。而你进行这样的观察是没有错误的。
如果接受这个假设，不想两组组内都不显著的区域，则可以采用这个制作MASK的方法。我推荐这样来进行可能方便一点：
1. REST Slice Viewer，将第一组的单样本T检验用某种多重比较校正方法完成校正。点save clusterS.
2. REST Slice Viewer，将第二组的单样本T检验用某种多重比较校正方法完成校正。点save clusterS.
3. 用REST Image Calculator，(i1~=0) + (i2~=0) 这样的表达式。
你完全是可以在BrainMask内进行统计的。如果你接受以上的假设，那么你对种指标都应该进行独立的MASK制作。