Submitted by liufeng on Mon, 12/24/2012 - 02:01
老师好：
最近有些疑惑来自GRF校正，希望来这里一起讨论下。
1、看到文章中经常报voxel Z>2.3， cluster level p<0.05;其实这个Z对应的是我们的p=0.01对吗？那么有没有像alphasim那样的一个表格，有Z值和p值的对应关系，还是这个当前的Z就是正态分布下的Z值，当然，如果是这样，由Z值到p值转换也就很简单了。
2、为什么很多文章都是Z>2.3,也就是voxel p<0.01；很少有设定voxel p<0.05的。如果voxel p和cluster p不一样，reviewer会不会问这方面的问题。
3、在您看来，用这种校正做双样本t检验校正的话，强度如何？与FWE、FDR、alphasim相比？不过FWE校正已经包含了随机场原理吧？那么他们有多大的区别呢？
谢谢！
Submitted by YAN Chao-Gan on Sat, 12/29/2012 - 06:44 Permalink
Re: 关于GRF校正
你好！
在另外一个贴子中，有关于这个问题的讨论，欢迎参考。http://www.restfmri.net/forum/node/1126
1. FSL's Z>2.3 corresponds to one-tailed VoxelPThreshold = 0.0107. |Z|>2.3 corresponds to two-tailed VoxelPThreshold = 0.0214.
对应关系可以在REST slice viewer里面定义DF为Z图像，就可以看见Z和P的转换了（双边）。或者，matlab的norminv函数可以做这样的工作。
这些文章中，通常都是做两次one-tailed检验，再加起来显示。即在GUI的two-tailed way中，定义VoxelPThreshold = 0.0214， ClusterPThreshold = 0.1;
2. Z>2.3的文章很多，这样选一般reviewer不会问这个问题。后来FSL出了一个TFCE的方法，避免对voxel p进行设置。
3. 这些方法除了FDR之外，都需要考虑平滑程度的问题。相对来说AphaSim较松一些，SPM的FWE实现最严，可能与不同程序对平滑程度的估计有关。