mask出错了，能怎么改正么

Submitted by chunhuichen on Fri, 04/26/2013 - 21:12

各位老师们好！

最近处理的一批数据，其中有些被试是头部上下颠倒的，于是用fsl翻转过来并在fslview里看着正常后，后用DEPARSFA处理。结果是，那些头部曾经颠倒了的被试result都为空，而其他没有颠倒的被试都挺正常的，看PicturesForChkNormalization也是那些颠倒的被试normalize没配齐。

我的处理步骤是，slice timing, realign, coregister, Newsegment+DARTEL, Nuisance covaraite regression (poly trend 1, Fiston 24, Global signal, WM signal, CSF signal), Warp Masks into individual space, ALFF/ReHo等，normalize， smooth。 本来想贴图上来的，可能是网速慢贴不上，只好这么简单描述了。

然后我就逐个文件去检查，发现到FunImgARCF看着都正常，头部颠倒的和没有颠倒的被试都差不多，T1ImgNewSegment 灰白质分割也是正常的，但Masks 和Results里都是空的。

所以我怀疑是从Warp Masks into individual space这一步就出错了，但是我能做的也只是勾选它而已啊，我该怎么办呢？如果说可能是原始文件转得不对，但是我在fslview里看着已经转过来了啊。

另，检查到FunImgARC的时候发现，做完Nuisance covariate regerssion 之后的图像很乱看着像加了白噪音啊，是本来就该这样还是我勾选的协变量太多了？

多谢！