关于Rest中的Extract ROI Signals | Forum of resting-state fMRI

Submitted by Learner--ECNU on Mon, 10/21/2013 - 12:46

老师好：我想问下，我得到全脑的Reho、Alff、Falff图，然后我做了一个ROI的Mask，分别对Reho、Alff、Falff图进行Extract ROI Signals，得到的结果都有一个TXT文件，这里面的数据是不是每个被试ROI的平均Reho值、Alff值、Falff值？

Comments

Submitted by chengjinming861013 on Mon, 10/21/2013 - 15:43 Permalink

对，提取的是ROI内的平均值。

Submitted by Learner--ECNU on Mon, 10/21/2013 - 16:34 Permalink

谢谢老师的回答再追问一句，用VBM分析所得到的灰质信息mwrp1文件，如果也提取某个ROI，得到一个值，这个值是ROI的体积吗？

Submitted by Learner--ECNU on Mon, 10/21/2013 - 16:34 Permalink

补充下，那个值是ROI的灰质体积吗？

Submitted by ZHANG_RESTadmin on Mon, 10/21/2013 - 17:08 Permalink

mw应该是modulated normalized，可以认为是灰质体积。

Submitted by Learner--ECNU on Mon, 10/21/2013 - 19:18 Permalink

谢谢老师的及时回答再再追问下，文献当中说的灰质密度怎么算啊？

Submitted by ZHANG_RESTadmin on Tue, 10/22/2013 - 23:46 Permalink

上次我可能没看清你的问题里面的字母，
这次再确认一次：
mwc1***.img的是灰质体积
wc1***.img的是灰质密度
mwc2***.img的是白质体积
wc2***.img的是白质密度

c3那个是csf

Submitted by Learner--ECNU on Wed, 10/23/2013 - 10:42 Permalink

谢谢张老师的回答，我想问下我是用VBM处理T1像的结果，mwrp1 wrp1 mwrp2 wrp2分别对应你上面的文件，那包含信息应该和你说的一样吧？VBM中的dartel标准化方法和以T1 EPI为模板的标准化相比有什么优点？

Submitted by ZHANG_RESTadmin on Sat, 11/02/2013 - 01:50 Permalink

dartel不是特别清楚原理，但是据dartel文章说配准要更加精细和准确，T1 EPI等模板的配准是常规配置方法。