目前有病人组前后两次的静息态MRI数据和健康对照组的静息态数据,请问怎样进行统计呢?

 我们对病人组在治疗前后均扫描了静息态数据,也采集了健康对照组的静息态数据,在对ALFF用REST统计上犯了难,目前的试了一下,我的步骤和问题如下:
1.病人前后和对照共三组数据做ANOVA,得到了一个脑区,再在这个脑区内用REST做两两比较(该脑区为mask),发现病人治疗前该脑区内大部分voxel比对照高(REST双样本T检验),而治疗后该脑区大部分voxel比治疗前更高(用了REST的配对T检验),但是治疗后的影像与对照比却没有得到阳性发现(REST双样本T检验,跟前面是同样的多重比较矫正水平),对于这一点我就觉得纳闷,为什么治疗前比对照高,治疗后更高,治疗后比对照反而没有影像学的阳性发现?
2、我也知道不是独立样本不适合做配对T检验和ANOVA,但是有什么更合适的办法吗?或者现在我的方法有没有可以被接受的可能?
请老师们指导一下了,谢谢

你好。
我也不清楚你治疗前后结果倒转的原因,我觉得最有可能是数据处理出现问题。
介于这个检验的方法,我刚过一些治疗效果的文章,大多都是选择治疗前的被试还有另外一批治疗后的被试。显然你这个是独立样本和配对样本的结合,我认为你的检验是可以的。

1、我觉得这种情况下做ONE-way ANOVA有一些问题:病人前后是within-subject,而与正常人比较,则是between-subject。我不清楚有没有专门的这种ANOVA。由于你的“治疗”前后比较,并没有设置对照(安慰剂或者对照治疗),这种差异,只能说是前后的差异。这种差异的解释可以有很多可能性:比如,(1)第一次扫描时正常、第二次变得不正常;(2)第一次扫描不正常、第二次扫描时变得正常;等等。但不管怎样,无法说清楚是治疗变化、还是自然变化。
2、“不是独立样本不适合做配对T检验和ANOVA”,病人前后比较,最好做paired t-test;病人与正常人的比较,则用two-sample t-test。
3、具体到你目前的设计(如果你已经提供了全面的信息的话),我建议先比较病人第一次与正常人,得到异常脑区;第二步,在这些脑区内部,比较前后差异。相对来说,病人第一次扫描与正常人的比较,这种设计问题不大;病人前后的比较,无法说清楚是治疗变化、还是自然变化。

 明白了,谢谢臧老师的细致解答,我正是先比较了正常人与病人治疗前的差异,再比较病人治疗后的变化,不过如果局限于病人被发现的“脑区”,治疗后并没有统计学意义的变化,恰恰病人两次扫描变化的脑区在之前并没有被发现异常,但是病人这个脑区的改变恰恰跟症状的恢复有相关,我推测是由于这种药物治疗的作用——并非去逆转异常脑区,而是在正常脑区上做文章,接下来我也在搜关于这个药物在大脑作用机制的文献来支持。

 你提到的这此脑区,即治疗之前未显示明显异常(与正常人比较无发现明显差异)、然后治疗之后发生了明显变化,并且这个脑区的变化(治疗前后的差值)与症状恢复(治疗前后的症状评分的差值)有关。这些脑区也的确是很值得关注的。