用freesurfer提取皮层后进行reho计算是不是所谓的2d -reho。

Submitted by lhldrs on Sun, 11/15/2015 - 18:11

1.关于2d reho臧老师之前由回答过，由于serfer计算复杂，没有进行下去。现在审稿专家提出可以freesurfer提取皮层再进行rheo的计算，想请教各位老师这样做算不算2d -reho。freesurfer能处理EPI的数据吗？还是只能处理结构像？
原文是这样的：The surface structure is too complicated to calculate? Freesurfer can automatically reconstruct cerebral cortex within about 20 hours, and then give different maps with different spatial resolutions in different fsaverage space. All these should not influence qualitative findings and answers to core scientific questions. 
2.还有一个问题就是目前有没有fmri与DTI进行相关的分析，有什么处理方法。

Comments

Submitted by ZangYF on Mon, 11/16/2015 - 06:05

1、在Surface上计算ReHo是2D ReHo，是由左西年博士首先报导的。你可以联系一下左西年博士，他的程序应该可以下载的。前面天在南宁培训班上听他说，现在的计算速度已经比较快了。
2、resting-state fMRI与DTI的相关性的论文非常多。一是定性的研究，通过肉眼观察，fiber tract与functional connectivity在空间上是否吻合；二是定量的相关分析，具体方法只能看具体的研究内容了。下面两篇文章仅供参考：

Ji GJ, Zhang Z, Xu Q, Zang YF, Liao W, Lu G. Generalized tonic-clonic seizures: aberrant interhemispheric functional and anatomical connectivity. Radiology. 2014 Jun;271(3):839-47. doi: 10.1148/radiol.13131638.

Han Y, Yang Y, Lv YT, Zhu CZ, He Y, Tang HH, Gong QY, Luo YJ, Zang YF, Dong Q. Gray matter density and white matter integrity in pianist’s brain: a combined structural and diffusion tensor MRI study. Neurosci Lett. 2009 Jul 31;459(1):3-6.

Submitted by lhldrs on Wed, 11/18/2015 - 21:40

 谢谢臧老师的解答，看到一篇文章，提到DTI与FMRI用相同的种子点提取time courses进行相关，这个合理吗？照理说一个研究灰质一个研究白质，他fMRI使用FC进行的，其他像reho跟alff能否也这样？