3D ASL数据分析问题

各位好

         我在Upenn神经成像中心的磁共振机器上扫完ASL之后生成的3DASL数据只有两个:一个mean*3D图像文件和一个mean*dat文件,跟restplus中3D ASL normalzie的help里提到的有cbf.nii和pfefmo.nii似乎不同, 在外人的帮助下,我们将这个mean图像转换生成了60个f*.nii文件和另外三个文件(M000.nii, M002.nii, meanperf.nii),似乎跟王泽老师的ASLtbx里差异比较大,如果用restplus分析,接下来该怎么做呢?谢谢!

您好,RESTplus里面的3D ASL Normalization的batch code是王泽老师的asltbx。我把它做成GUI的初衷是用于分析GE的3D ASL,对它进行标准化和平滑。原理比较简单,GE的3D ASL可以得到M0图、差值图和CSF图,大概思路是: coregister M0图像到T1像,同时把CSF图带过去,对T1像进行分割(基于SPM12),使用分割的信息对CSF图进行标准化。代码做成GUI后,自由度小了很多,所以需要严格按照软件的格式来整理数据。希望这些信息对你有帮助。

 

您好,RESTplus里面的3D ASL Normalization的batch code是王泽老师的asltbx。我把它做成GUI的初衷是用于分析GE的3D ASL,对它进行标准化和平滑。原理比较简单,GE的3D ASL可以得到M0图、差值图和CSF图,大概思路是: coregister M0图像到T1像,同时把CSF图带过去,对T1像进行分割(基于SPM12),使用分割的信息对CSF图进行标准化。代码做成GUI后,自由度小了很多,所以需要严格按照软件的格式来整理数据。希望这些信息对你有帮助。