[FAQ] 其它fMRI数据分析软件(如AFNI、MICA、GIFT)的结果是否可以用RESTplus继续分析

我们在MRI中拿到的原始数据是DICOM格式的,扫描机器品牌不同,扩展名可能不一样(如扩展名为IMA、DCM或没有扩展名),这些都属于DICOM格式。我们在使用相应的fMRI处理软件进行数据分析前,都会使用对应的工具首先进行格式转换,比如RESTplus默认会将数据转换为NIFTI格式(.nii扩展名)。不同软件的默认文件格式是不一样的,比如AFNI的默认格式有两个文件HEAD文件和BRIK文件。也就是说,假如你使用AFNI的命令来做数据处理,如果没有特殊设置,通常来讲得到的文件会是一对文件:HEAD和BRIK。做完的这个结果,如果想用RESTplus做进一步分析,先用对应命令(3dAFNItoNIFTI)做一个格式转换就可以了。NIFTI是一种通用格式,大多数软件都支持NIFTI格式。同理,RESTplus处理完的结果,默认都是NIFTI格式的,可以直接拿到支持NIFTI格式的软件中使用。

注意:文件扩展名,就是后面的那个后缀(.dcm或.ima),和文件格式不完全等同,文件格式可以理解成一种文件规范,比如DICOM格式,默认前面若干个字节存储着被扫描人的信息,以及机器型号等,是一种文件规范。扩展名是一种标示,换句话说,有可能同一种文件规范有不同的扩展名。

 

fMRI的数据分析软件通常都是支持NIFTI格式的(.nii扩展名),比如:SPM、FSL、AFNI、DPARSF、MICA、GIFT、Gretna等等

相关提问:

http://www.restfmri.net/forum/node/2364

http://www.restfmri.net/forum/node/2365

Error | Forum of resting-state fMRI

Error

The website encountered an unexpected error. Please try again later.