在fMRI中，MASK也是一副脑图，如果用看图软件（如MRIcron，REST Viewer等）打开一副MASK，就会发现，这幅图上面的数值，只有0或者1。MASK脑图通常的作用是去掉我们不感兴趣的区域。我分一下几个步骤介绍。
（1）如何做MASK
得到MASK的方式有很多，比如我们做完统计检验，可以得到一张T图，卡完阈值后，我们可能只对某一个特定的cluster感兴趣，这样我们就可以做一个mask，这个mask只包括我们特定感兴趣的cluster。或者是，我们对某一个AAL脑区感兴趣，想把这个脑区做成MASK。
以上两种情况，在RESTplus的Viewer里面，都可以根据自己的抢矿，单独保存某一个指定的cluster（选中cluster后，点击save cluster按钮即可）。存下来会得到两个文件，有一个是binary的，即，脑图只包括0或1。
注：假如我们的cluster是从其他软件得到的，要自己把cluster文件做成只包含0或1的文件，使用RESTplus里面的image calculator,载入该cluster的文件，标号为i1,在公式的位置输入，i1./i1即可生成该脑图的binary文件。也就是说，我们用该脑图自己除以自己，有值的位置就会变成1，原来没有值的位置仍然是0.
（2）MASK重采样。
当我们把MASK用于脑图文件时，没有重采样是常见错误。因为我们做完的MASK的维度或voxel size，很有可能和我们脑图的维度或voxel size是不吻合的。这样在使用的时候就会提醒矩阵不匹配一类的错误。
重采样使用的工具是RESTplus里的，Reslice Image工具。
（3）应用MASK
得到我们所需要的MASK后，要将MASK用于我们的脑图中。可以使用Image calculator，载入MASK文件，然后载入脑图文件，使用公式i1.*i2即可。