Submitted by carolm2 on Sat, 06/04/2016 - 19:29
大家好!我是刚学习静息态fMRI数据处理的新手。最近遇到的一个一直不知道怎么解决的问题就是,做完配准之后的PicturesForChkNormalization文件夹生成的图像显示有部分被试的图像缺角了,而且甚至有被试一半的大脑都缺失了,配准出来的wra图像也是有问题的,对这些有问题的图像做reorient也没有办法解决这个问题。有另外一些被试是check文件夹的图像的缺失很严重,但实际上配出来的wra图像就只是缺一点点,不算特别严重的。在做配准前(即做完去除前10个时间点和头动矫正之后)这些图像都是没有缺失的,非常完整。图像缺失直接导致后面计算出来的mask也是缺失的,所以没办法做后续的分析了。
两种情况的图像我都放在附件里面了。求问到底为什么会出现这样的问题,以及要怎么解决呢?
十分感谢各位前辈!
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Submitted by jiaxize on Sat, 06/04/2016 - 21:03 Permalink
Re: 求问关于配准之后图像缺失的问题!非常感谢!
您好,因为在做标准化的时候,需要进行很多变换,所以很多原因会导致数据配准不好。
reorient确实可以提高配准效果。
如果你已经尝试各种办法,我建议试一下EPI配准,或许可以配上。
Submitted by carolm2 on Mon, 06/06/2016 - 16:13 Permalink
Re: 求问关于配准之后图像缺失的问题!非常感谢!
好的,谢谢!现在已经可以成功配准了!