rest后处理的一些问题

Submitted by shallvin on Thu, 11/24/2016 - 21:34

请教各位老师：

我在用REST做extract ROIsignal时，填写了一个ROI区域，结果出来三个样本分别是0.572,0.571和0.551，我想请问信号值有没有阈值，大于多少才算阳性？还有我加入2个ROI，ResultCorr结果显示的相关系数是值得两个ROI的连接值吗？

还有个问题就是我用DPARSF跑出来的数据做power spectrum得不到谱线，但是用GIFT的结果却能得到谱线，这是什么原因？

因为我是放射科医生，对有些数学问题和处理步骤不太了解，还请各位老师不吝赐教。

Submitted by gaolei6096 on Sat, 11/26/2016 - 01:11

我在用REST做extract ROIsignal时，填写了一个ROI区域，结果出来三个样本分别是0.572,0.571和0.551，我想请问信号值有没有阈值，大于多少才算阳性？还有我加入2个ROI，ResultCorr结果显示的相关系数是值得两个ROI的连接值吗？
 
RE：这里都没提具体被提取的指标是什么。这完全取决于被提取信号的对象（这里主要就是那些指标的maps），以及应用在这之上的mask ROI本身的特征（组织类型、大小、解剖位置等）。这些所有指标本身都没有明确的阴性或阳性，这里提取的数值仅仅是数值而已。阴性和阳性是要建立在两样本统计分析的基础上（1vsGroup，two independent groups，paired-groups，etc.）。Corr代表的是ROI之间的相关系数。
 
还有个问题就是我用DPARSF跑出来的数据做power spectrum得不到谱线，但是用GIFT的结果却能得到谱线，这是什么原因？
 
这两个好像不是一回事，dparsf做spectrum只能定位到体素，具体要做更进一步的分析可能需要利用这些代码自己编程。后者是GIFT顺带的，可能不局限在低频段，也好像不能直接利用。
 
 
因为我是放射科医生，对有些数学问题和处理步骤不太了解，还请各位老师不吝赐教。

Submitted by shallvin on Mon, 11/28/2016 - 09:51

谢谢高老师的讲解我还是有些不太明白FC也是做几个ROI的相关性，extract ROIsignal也是做几个ROI的相关性，那么这两个相关性有什么不同？
还有如果按您说的是不是我们单纯用DPARSF跑出来的数据做不出谱线，但是工具里面的power spectrum可以分析其他软件做出来的谱线？

Submitted by gaolei6096 on Mon, 11/28/2016 - 09:56

FC是我们主观刻意去探索的，所以使用correlation去做，但是extract ROIsignal在提取ROI信息的同时，顺带着做一个correlation，就是顺带做的，如果不需要就可以不考虑correlation的结果。

谱线如果只是呈现结果，让结果图变得好看一些，可能matlab图形工具就可以。好像不行，这里我还是不太清楚。