预处理的疑问以及功能连接校正方法

1,在1,在视频中,有关于去除头动较大的数据的问题,里面说的现在很多不在依据A标准(平动和转动大于多少mm)来作为排除标准,而是应用B标准(meanFD>0.2(Jenkinson))来作为排除标准,而我在实际预处理最后查看时发现用A标准排除的数据要比B标准排除的数据多,而且这个B标准我的理解是您说的Scrubbing这一步做的也就是您说的这一步一般在辅助材料里面写的。所以现在有些困惑了,我应该是依据A标准还是B来去除头动过大被试?因为如果依据B来去除那Scrubbing这一步那是不是一定要做才能出来meanFD(Jenkinson)这个参数,那样不就和说的Scrubbing这一步在辅助材料做相矛盾了?
1,在视频中,有关于去除头动较大的数据的问题,里面说的现在很多不在依据A标准(平动和转动大于多少mm)来作为排除标准,而是应用B标准(meanFD>0.2(Jenkinson))来作为排除标准,而我在实际预处理最后查看时发现用A标准排除的数据要比B标准排除的数据多,而且这个B标准我的理解是您说的Scrubbing这一步做的也就是您说的这一步一般在辅助材料里面写的。所以现在有些困惑了,我应该是依据A标准还是B来去除头动过大被试?因为如果依据B来去除那Scrubbing这一步那是不是一定要做才能出来meanFD(Jenkinson)这个参数,那样不就和说的Scrubbing这一步在辅助材料做相矛盾了?
2.我尝试用dpabi中的DPARSFA处理了相关数据(点击了Head motion Scrubbing regressors这一步,设置了FD(jenkinson>0.2),依据上面的B标准去除了一些被试数据,做了正常被试(1组)和患者组(2组)的感兴趣区域的功能连接,然后在单样本T检验结果我用REST中的viewer查看,涉及到最后要做双样本T检验,我想用1组和2组在单样本t检验时的显著脑区做并集mask,在选取校正方法和设置P值上面有点疑惑,查看相关的文献,在关于单样本T检验上校正方法选择没有详细说明,想请教老师,如果二组在单样本的结果被试选取FDR校正P<0.001,test type:one-tail时,应用他们的合集做了mask,最后用于双样本的mask中,在进行双样本结果分析时是否必须也要用同样的校正方法进行分析。
3。还有之前看论坛上有老师提问关于做功能连接两组被试人数的问题,是不是分析时最好二组被试必须人数差不多相同?或者最后还是依据我们实际分析结果而定?
3还有之前看论坛上有老师提问关于做功能连接两组被试人数的问题,是不是分析时最好二组被试必须人数差不多相同?或者最后还是依据我们实际分析结果而定?视频中,有关于去除头动较大的数据的问题,里面说的现在很多不在依据A标准(平动和转动大于多少mm)来作为排除标准,而是应用B标准(meanFD>0.2(Jenkinson))来作为排除标准,而我在实际预处理最后查看时发现用A标准排除的数据要比B标准排除的数据多,而且这个B标准我的理解是您说的Scrubbing这一步做的也就是您说的这一步一般在辅助材料里面写的。所以现在有些困惑了,我应该是依据A标准还是B来去除头动过大被试?因为如果依据B来去除那Scrubbing这一步那是不是一定要做才能出来meanFD(Jenkinson)这个参数,那样不就和说的Scrubbing这一步在辅助材料做相矛盾了?
 
2.我尝试用dpabi中的DPARSFA处理了相关数据(点击了Head motion Scrubbing regressors这一步,设置了FD(jenkinson>0.2),依据上面的B标准去除了一些被试数据,做了正常被试(1组)和患者组(2组)的感兴趣区域的功能连接,然后在单样本T检验结果我用REST中的viewer查看,涉及到最后要做双样本T检验,我想用1组和2组在单样本t检验时的显著脑区做并集mask,在选取校正方法和设置P值上面有点疑惑,查看相关的文献,在关于单样本T检验上校正方法选择没有详细说明,想请教老师,如果二组在单样本的结果被试选取FDR校正P<0.001,test type:one-tail时,应用他们的合集做了mask,最后用于双样本的mask中,在进行双样本结果分析时是否必须也要用同样的校正方法进行分析。
 
3还有之前看论坛上有老师提问关于做功能连接两组被试人数的问题,是不是分析时最好二组被试必须人数差不多相同?或者最后还是依据我们实际分析结果而定?

Re: 预处理的疑问以及功能连接校正方法

这个问题你可以发邮件咨询严老师。

(1)A+B标准都需要吧;在确保A标准的情况下,控制FD,scrubbing超过一定阈值的volumes;

(2)单样本和双样本检验本身使用的校正方式不一定非要相同,主要是双样本检验;不需要;两方面所能经得起校正的能力是不同的;

(3)很多文献中基本上人数相差不多,但是也有部分文献两组人数是相差很多,可能关键在于组间人口统计学资料是否匹配?

Re: 预处理的疑问以及功能连接校正方法

嗯。非常谢谢高老师

Re: 预处理的疑问以及功能连接校正方法

昨天又遇到了一个问题,老师,我在两组人群的的基于ROI的双样本T检验选用的(A threshold of < 0.001 with a cluster size ≥ 5 voxelswhich corresponds to a whole-brain cluster level corrected to p<0.05,was set by AlphaSim to detect significant between-group differences),然后发现了有显著差异脑区,我在分别在二组的FC数据中提取了A(ROI与显著差异脑区的timecourse),在进行二组人群的A值做error bar(见下图),发现误差线非常大,那是不是意味着这部分数据的误差太大了可能不能用?犯愁中。谢谢老师百忙之中的解惑

Comment viewing options

Select your preferred way to display the comments and click "Save settings" to activate your changes.