预处理的疑问以及功能连接校正方法

Submitted by psyzhang on Sun, 04/09/2017 - 21:36
1，在1，在视频中，有关于去除头动较大的数据的问题，里面说的现在很多不在依据A标准（平动和转动大于多少mm）来作为排除标准，而是应用B标准（meanFD>0.2(Jenkinson)）来作为排除标准，而我在实际预处理最后查看时发现用A标准排除的数据要比B标准排除的数据多，而且这个B标准我的理解是您说的Scrubbing这一步做的也就是您说的这一步一般在辅助材料里面写的。所以现在有些困惑了，我应该是依据A标准还是B来去除头动过大被试？因为如果依据B来去除那Scrubbing这一步那是不是一定要做才能出来meanFD（Jenkinson）这个参数，那样不就和说的Scrubbing这一步在辅助材料做相矛盾了？
1，在视频中，有关于去除头动较大的数据的问题，里面说的现在很多不在依据A标准（平动和转动大于多少mm）来作为排除标准，而是应用B标准（meanFD>0.2(Jenkinson)）来作为排除标准，而我在实际预处理最后查看时发现用A标准排除的数据要比B标准排除的数据多，而且这个B标准我的理解是您说的Scrubbing这一步做的也就是您说的这一步一般在辅助材料里面写的。所以现在有些困惑了，我应该是依据A标准还是B来去除头动过大被试？因为如果依据B来去除那Scrubbing这一步那是不是一定要做才能出来meanFD（Jenkinson）这个参数，那样不就和说的Scrubbing这一步在辅助材料做相矛盾了？
2.我尝试用dpabi中的DPARSFA处理了相关数据（点击了Head motion Scrubbing regressors这一步，设置了FD（jenkinson>0.2）,依据上面的B标准去除了一些被试数据，做了正常被试（1组）和患者组（2组）的感兴趣区域的功能连接，然后在单样本T检验结果我用REST中的viewer查看，涉及到最后要做双样本T检验，我想用1组和2组在单样本t检验时的显著脑区做并集mask，在选取校正方法和设置P值上面有点疑惑，查看相关的文献，在关于单样本T检验上校正方法选择没有详细说明，想请教老师，如果二组在单样本的结果被试选取FDR校正P<0.001,test type：one-tail时，应用他们的合集做了mask，最后用于双样本的mask中，在进行双样本结果分析时是否必须也要用同样的校正方法进行分析。
3。还有之前看论坛上有老师提问关于做功能连接两组被试人数的问题，是不是分析时最好二组被试必须人数差不多相同？或者最后还是依据我们实际分析结果而定？
3还有之前看论坛上有老师提问关于做功能连接两组被试人数的问题，是不是分析时最好二组被试必须人数差不多相同？或者最后还是依据我们实际分析结果而定？视频中，有关于去除头动较大的数据的问题，里面说的现在很多不在依据A标准（平动和转动大于多少mm）来作为排除标准，而是应用B标准（meanFD>0.2(Jenkinson)）来作为排除标准，而我在实际预处理最后查看时发现用A标准排除的数据要比B标准排除的数据多，而且这个B标准我的理解是您说的Scrubbing这一步做的也就是您说的这一步一般在辅助材料里面写的。所以现在有些困惑了，我应该是依据A标准还是B来去除头动过大被试？因为如果依据B来去除那Scrubbing这一步那是不是一定要做才能出来meanFD（Jenkinson）这个参数，那样不就和说的Scrubbing这一步在辅助材料做相矛盾了？
 
2.我尝试用dpabi中的DPARSFA处理了相关数据（点击了Head motion Scrubbing regressors这一步，设置了FD（jenkinson>0.2）,依据上面的B标准去除了一些被试数据，做了正常被试（1组）和患者组（2组）的感兴趣区域的功能连接，然后在单样本T检验结果我用REST中的viewer查看，涉及到最后要做双样本T检验，我想用1组和2组在单样本t检验时的显著脑区做并集mask，在选取校正方法和设置P值上面有点疑惑，查看相关的文献，在关于单样本T检验上校正方法选择没有详细说明，想请教老师，如果二组在单样本的结果被试选取FDR校正P<0.001,test type：one-tail时，应用他们的合集做了mask，最后用于双样本的mask中，在进行双样本结果分析时是否必须也要用同样的校正方法进行分析。
 
3还有之前看论坛上有老师提问关于做功能连接两组被试人数的问题，是不是分析时最好二组被试必须人数差不多相同？或者最后还是依据我们实际分析结果而定？

Submitted by gaolei6096 on Thu, 04/13/2017 - 08:43

这个问题你可以发邮件咨询严老师。

（1）A+B标准都需要吧；在确保A标准的情况下，控制FD，scrubbing超过一定阈值的volumes；

（2）单样本和双样本检验本身使用的校正方式不一定非要相同，主要是双样本检验；不需要；两方面所能经得起校正的能力是不同的；

（3）很多文献中基本上人数相差不多，但是也有部分文献两组人数是相差很多，可能关键在于组间人口统计学资料是否匹配？

Submitted by psyzhang on Thu, 04/13/2017 - 10:57

昨天又遇到了一个问题，老师，我在两组人群的的基于ROI的双样本T检验选用的（A threshold of p < 0.001 with a cluster size ≥ 5 voxels，which corresponds to a whole-brain cluster level corrected to p<0.05,was set by AlphaSim to detect significant between-group differences),然后发现了有显著差异脑区，我在分别在二组的FC数据中提取了A（ROI与显著差异脑区的timecourse），在进行二组人群的A值做error bar（见下图），发现误差线非常大，那是不是意味着这部分数据的误差太大了可能不能用？犯愁中。谢谢老师百忙之中的解惑