请教关于大脑功能网络小世界性质的问题

各位老师好,因为我是刚学,人也比较笨,所以问题很多,有些问题可能很傻,麻烦大家耐心指教啊,十分感谢!
1、因为我想做大脑的小世界性质分析,所以使用Dparsf得到了AAL90个区域的时间序列,但我想要的是90个区域的功能连接图和z-map,要怎么办?是不是要分别制作那90个ROI的mask?有没有简便的方法?
2、在制作AAL的一个ROI的mask的时候,Cluster Size是有什么用的,要怎么设置?我看了Course_Data_Process_of_Rest_fMRI_Part2_Chinese_100820这个视频但还是不明白,能否讲解一下?
3、后来我想反正我只是检验小世界性,只需要z值就行了,于是用corrcoef函数通过前面得到的AALTC求出90个区域的R值,再转换成z值,然后进行后面的计算,这种做法有没有什么不妥啊?
4、检验小世界性时,需要产生100个相应的随机网络和规则网络,是针对每个病人都要产生这100个随机网络么?我看文献上说按照马尔可夫链规则产生,那个规则具体是怎样的?就算这个规则能保证随机网络的平均度和边数与病人的网络相同,怎么能保证度分布还是相同的呢?老师那里有没有检验小世界性的做好的软件,是否是开放的?

1. 如果要得到90个功能连接图,则需要分别制作90个ROI。具体方法可参考视频。
2. Cluster size里面,只需要设置连接准则就可以,如果不会设的话,看一下提示,输入SPM_Criterion即可。
3. 这个方法没有问题。
4. 你可以使用brain connectivity toolbox http://www.indiana.edu/~cortex/connectivity_toolbox.html,Rubinov M, Sporns O (2010) Complex network measures of brain connectivity: Uses and interpretations. Neuroimage 52:1059-1069 一文中有介绍。

你好
在制作AAL的一个ROI的mask的时候,我想知道您是怎么制作的。
我是想要通过AAL模板定义一些ROI,来做功能连接的。我选择了“rest”-“Function Connectivity”-"ROI wise"-“Add ROI”,我想选择通过AAL模板来定义ROI,根据已有的先验知识选择若干aal的脑区作为感兴趣区来做。点击“next”后,进入slice view的界面,我也看了关于讲解slice view的讲解,可是还是不太清楚 怎样就算选择好了ROI.,做好了mask。

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