请教关于大脑功能网络小世界性质的问题

Submitted by Champagne on Fri, 10/15/2010 - 20:58

各位老师好，因为我是刚学，人也比较笨，所以问题很多，有些问题可能很傻，麻烦大家耐心指教啊，十分感谢！
1、因为我想做大脑的小世界性质分析，所以使用Dparsf得到了AAL90个区域的时间序列，但我想要的是90个区域的功能连接图和z-map，要怎么办？是不是要分别制作那90个ROI的mask？有没有简便的方法？
2、在制作AAL的一个ROI的mask的时候，Cluster Size是有什么用的，要怎么设置？我看了Course_Data_Process_of_Rest_fMRI_Part2_Chinese_100820这个视频但还是不明白，能否讲解一下？
3、后来我想反正我只是检验小世界性，只需要z值就行了，于是用corrcoef函数通过前面得到的AALTC求出90个区域的R值，再转换成z值，然后进行后面的计算，这种做法有没有什么不妥啊？
4、检验小世界性时，需要产生100个相应的随机网络和规则网络，是针对每个病人都要产生这100个随机网络么？我看文献上说按照马尔可夫链规则产生，那个规则具体是怎样的？就算这个规则能保证随机网络的平均度和边数与病人的网络相同，怎么能保证度分布还是相同的呢？老师那里有没有检验小世界性的做好的软件，是否是开放的？

Submitted by YAN Chao-Gan on Mon, 10/18/2010 - 12:39

1. 如果要得到90个功能连接图，则需要分别制作90个ROI。具体方法可参考视频。
2. Cluster size里面，只需要设置连接准则就可以，如果不会设的话，看一下提示，输入SPM_Criterion即可。
3. 这个方法没有问题。
4. 你可以使用brain connectivity toolbox http://www.indiana.edu/~cortex/connectivity_toolbox.html，Rubinov M, Sporns O (2010) Complex network measures of brain connectivity: Uses and interpretations. Neuroimage 52:1059-1069 一文中有介绍。

Submitted by 小白 on Mon, 10/31/2011 - 16:19

你好
在制作AAL的一个ROI的mask的时候，我想知道您是怎么制作的。
我是想要通过AAL模板定义一些ROI,来做功能连接的。我选择了“rest”-“Function Connectivity”-"ROI wise"-“Add ROI”，我想选择通过AAL模板来定义ROI，根据已有的先验知识选择若干aal的脑区作为感兴趣区来做。点击“next”后，进入slice view的界面，我也看了关于讲解slice view的讲解，可是还是不太清楚 怎样就算选择好了ROI.，做好了mask。