rest做FC时，用的是相关还是偏相关

Submitted by insular on Wed, 11/17/2010 - 16:10

老师，您好。

rest做FC时，用的是相关还是偏相关。
我查看了rest文件夹里的fc.m

里面有一部分求相关，直接用的是matlab内置的corrcoef

有一部分求相关用的是自己编写的函数。

这2个都是只是求相关的。不知道以后能不能导入求偏相关的函数
？

Submitted by YAN Chao-Gan on Thu, 11/18/2010 - 11:13

如果没有加Covariables，则是普通的Pearson相关。
如果加了Covariables，则是偏相关。
求x和y在控制z时的偏相关，做法可以是：在x和y中都回归掉z，再求Pearson相关。
我们课题组的朱芸芸正在从事这方面的工作。

Submitted by insular on Thu, 11/18/2010 - 14:26

fc.m里面，
做voxel-vise的相关： 定义的ROI 的time course与全脑某个voxel的time course做相关时，还像没有把其他的voxel作为covariables。由于voxel-vise涉及的点很多，好像做偏相关不太可能吧？

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另外，对于做ROI 与 ROI之间的相关时，rest的默认步骤（课程里的）好像只把头动，wm,csf等作为covariables，所以做的也不是偏相关？

如果要做2个ROI的偏相关的话，我是不是需要在去协变量时把其他ROI的也作为covariables？

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Submitted by YAN Chao-Gan on Thu, 11/18/2010 - 16:41

1. 计算voxel-wise时，不会把其他voxel的time couse做为covariables。但是你可以指定一些covariables，比如头动参数、脑脊液、白质信号等。

2. 即使计算ROI-wise，REST也不会自动添加covariables，需要你手动设置的。当然，在DPARSF中，你是可以针对每一个体素，都去除头动参数、脑脊液、白质信号影响，然后再提取感兴趣区ROI的时间序列。

3. 没有两个ROI的偏相关这个概念，提到偏相关，必然有需要控制的协变量。如果你有90个ROI，你想计算两个ROI在控制其他78个ROI时的偏相关系数，REST不提供此操作。但你可以用MATLAB的partialcorr命令。