FC用不用先做单样体T检验

Submitted by stevenlee697 on Fri, 12/16/2011 - 22:32

严老师好，您在讲课视频中说：REHO, ALFF, fALFF在做双样本T检验前要先做单样体T检验。FC没有说做不做。我在文献中看到FC的文章，有人先做单样体T检验，后做双样本T检验；有人直接做双样本T检验。这是怎么回事？？谢谢。

Submitted by YAN Chao-Gan on Sat, 12/17/2011 - 06:35

通常会做单样本T检验，来看各个组内的效应，通常也能给一个直观的印象。但注意，不能依靠单样本T检验进行推断，不能因为看到某脑区在A组显著，在B组不显著，就说A组比B组在该脑区活动更强。

另外，用两组单样本T检验显著的脑区，取并集成为mask，再做双样本T检验。有个朋友被审稿人说这样不妥，我仔细想想，也承认这样是有些问题的。
1. 这样你就看不到两组都不显著的脑区的差别。当然可以说这是因为不关心这样的区域。
2. 单样本显著做并集，意味着选出的脑区是 (1) 在A组显著但在B组不一定显著 （2）在A组不一定显著但在B组一定显著。这样，其实是将一些信息带入了双样本T检验的，从而减少了多重比较的次数。
因此，目前我还没想太好如何妥善的解决这个问题。而在功能连接中，假设报告r增加，其实隐藏中好几种情况：（1）正连接增加 （2）负连接减弱 （-5变成-1） （3）负连接变无 （4）负连接变正 （5）无连接变正。这种情况下，应该是需要把单样本T检验的信息引入。
如果一定要用单样本T检验创建mask，目前我能想的临时方案是：（1）仍然在全脑MASK内做多重比较校正（如果只关心灰质脑区的话，可以考虑用灰质MASK，以减少比较次数），做完多重比较校正之后，再与MASK相乘，只在MASK内看校正后的结果。（2）在双样本T检验时用更加严格的多重比较校正。并在文章注明这样的concern。但这样做有一定的风险。
欢迎大家就这样的问题进行讨论。

Submitted by stevenlee697 on Mon, 12/19/2011 - 21:42

"用两组单样本T检验显著的脑区，取并集成为mask，再做双样本T检验"具体操作是不是在REST image Calculator并集？我做的是FC，
表达式是 (i1>0)+(i2>0)>0
还是 (i1≠0)+(i2≠0)>0
抑或是 (i1≠0)+(i2≠0)≠0
我做的是FC,正负连接都要看，什么样的表达式更适当呢?
另外看您视频中说“不等于是一个小波浪线”，具体是什么样子？
谢谢。

Submitted by ZHANG_RESTadmin on Tue, 12/27/2011 - 21:10

如i1，i2为t图
表达式应该为
(abs(i1)>thr)+(abs(i2)>thr)>0
thr为你单样本t检验的阈值
但是这样没有考虑到cluster size的校正。

你可先用sliceviewer卡阈值（双边）后存0-1图出来，
然后用
(i1>0)+(i2>0)>0

Submitted by YAN Chao-Gan on Thu, 04/26/2012 - 06:53

 是不是说在进行双样本T检验的时候MASK处留空啊？

此外一般会选用BrainMask，并进行校正。

校正后，可以再在单样本T检验MASK里面看。