Resting-state fMRI topics

关于FC的问题,答复审稿人

各位老师,大家好,我的一篇文章大修,是研究基因型与疾病关系的。

我首先用VBM,做了基因型与组间(正常/患病)的方差分析,得到有两个cluster存在交互作用,然后用这两个cluster做全脑的FC,再做FC的方差分析

审稿人除了指出样本和效应量的问题以外,还提出“

Is there a bias for picking up ROI seeds correlated with GENE and then evaluating the relationship between GENE with the FC connected to these seed ROIs?'

不知道审稿人的这个问题怎么回答合适?多谢指教!



DPARSF提取roi时间序列的问题

尊敬的各位老师:

       我在用dparsf提取roi的时间序列,是自己定义的坐标点和半径的那种,同一个被试(之前我师姐提取过)同样的坐标和半径为什么我俩得出来的时间序列不一样?不知道是不是matlab版本的问题,就是想问这样的结果算是正常么?跪求各位老师和大神们的回答!!!

补充:均是做过预处理,并且参数也一致,我用的是advanced dparsf,她用的 basic dparsf

REST 的 power spectum

请教各位老师:

    REST的 power spectum 功能,提供了基本的时间-频率转换,但是它只能针对某个像素,如果对于ROI提取的时间序列,不知如何处理,刻意直接做FFT吗?

    另外,文献中计算的BOLD“能量”是不是就是频域曲线的曲线下面积?多谢指教!

REST 的 power spectum

请教各位老师:

      REST 的power spetum 提供了一个基本的 时间-频率转换功能,但是它只能对单个像素使用,如果 对于ROI的时间序列,应该截取那一段代码处理?

       另外,文献中计算的  power 是不是就是FFT以后的曲线下面积?多谢!

如何使用gift比较两组不同被试在不同扫描条件下的DMN差异?

你好,我目前正在研究两组数据间的差异。打算比较1.5T和3.0T不同机器扫描的数据间差异,新手一枚,望多指教!!!

存在几个问题,也顺便想问问楼主。

1、1.5T机器扫描的被试有10个,3.0T扫描的被试是另外的10subject。若想比较DMN的差异,是否有意义?

2、使用gift软件若要进行组独立成分分析group ICA,如何对这两组不同被试的数据进行group ICA呢? 目前,我只知道若是同样的10个subject的话,可以在数据输入的时候 选择2 session of 10subject。最后生成所有数据的mean component, 那要是1.5T和3.0T扫描的10个被试不同的要怎么进行group ICA呢?又如何进行DMN比较呢?一般是比较采用什么统计方法对何种差异进行比较?

请问老师们,知不知道如何Brain extraction 啊?

目前,正在使用dparsf处理猴脑数据,但是,采集的数据中存在大量的非脑组织(脖子以及颅外组织),最后配准到标准空间非常不理想,配准查看结果如下。如何提取脑组织啊,本人尝试用了fsl软件中的BET工具提取脑组织,但是结果不太理想,似乎去除了脑周围的部分,但是脖颈仍然未去除。请问,老师们怎么成功提取脑组织部分呢?