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DPARSF_V2.2_121225 / Warnings and empty .txt-files when writing single precision variables to .txt-files

Submitted by hbaetschmann on Tue, 01/15/2013 - 04:25

Doing ROI-to-ROI-FC-Analysis starting with FunImgARC-files produced warning-messages 'Warning: Attempt to write an unsupported data type to an ASCII file. Variable '...' not written to file.' when trying to write the result-files with extension '.txt' (ROICorrelation_subjxx.txt, ROICorrelation_FisherZ_subjxx.txt and ROISignals_subjxx.txt) in the result-directory 'Result/FC/FunImgARCF_ROISignals/'. Debugging showed, that the command 

save([fullfile(pathstr,['ROISignals_', name]), '.txt'], 'ROISignals', '-ASCII', '-DOUBLE','-TABS') (and 

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Alphasim question

Submitted by catherine1994 on Thu, 01/17/2013 - 08:47

Dear All,

After my paired t-test analysis, I would like to use Alphasim for multiple comparision correction....however, I'm not sure about the procedure...
From what I saw in the video, it seems to be 1) set the p value in slice viewer 2)check the list of alphasim correction provided in slice viewer and 3)enter in the cluster size value, etc accordingly....

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rest-gca

Submitted by 风清云淡 on Thu, 01/17/2013 - 15:33

各位老师：
 我是刚接触rest-gca，对一些基本问题不太了解，希望得到老师们的指导：
 问题一：我对voxel wise和roi wise的理解和定义不太清楚，两者的具体含义是什么，
 问题二：必须有mask吗，gca就用时间序列分析不就行吗
 问题三：我运行时 Exception occured     subscripted assignment  dimension mismatch的问题怎么回事

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z标准化的方法

Submitted by Red Stone on Thu, 01/17/2013 - 19:29

各位老师好：

从文献中看到，做完ICA之后，如果想做T-test，就得把ICA得到的成分做个z标准化，我想请问一下，这个z标准化可以用什么软件实现？

GIFT的utilities里面有一项是Z-shift，用它可以实现吗？我看manual上是这么说的：

“Z-shift is used to center the image distribution to zero based on the peak of the distribution.”

这句话是什么意思？

还望各位老师能为我解惑，谢谢！

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关于时间点time point 的填写问题

Submitted by huangyan on Thu, 01/17/2013 - 22:17

各位老师你们好，我是一名数据处理的新手，在预处理数据进行到detrend 这一步时想用dparsf软件处理，（因为时间点的问题前面都是只能用spm处理，在这一步spm总是报错）；当我把输入数据到dparsf，出现以下提示：
如果使用spm,则报错以下内容：

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使用rest1.8时候出现的一些问题

Submitted by chengjinming861013 on Fri, 01/18/2013 - 19:28

严老师：
   您好，我在使用rest1.8 sliceviewer时经常出现一些问题，想向您咨询一下。
1. 在服务器上用小键盘设定p值时经常出现乱码，而用大键盘时正常。
2. 校正后和校正前自动生成的Color bar是完全一样的，个人认为校正后的color bar 的top值和bottom值应该随着校正而改变。
3. color bar中两个色块中的整数代表的是上一个色块还是下一个色块，特别是map中的color值都是整数的时候，比如overlap，我发现有时候代表上一个色块，有时候代表下一个下一个色块。
     祝好

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补充一个校正问题

Submitted by chengjinming861013 on Fri, 01/18/2013 - 19:53

严老师：
   用rest1.8 sliceviewer中的一个校正问题。
我用alphasim校正（cluster size大于228，rmm=5），正负两个cluster有边相连，正cluster2021个voxels，而负的只有28个voxels也被保留下来了，而且归到正的cluster里了。请问这种情况是正常的吗，还是需要去掉那28个负的体素？

     祝好

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有关xjview

Submitted by fish on Sun, 01/20/2013 - 01:16

尊敬的各位老师：
       我把网上下的xjview的软件包解压到matlab的toolbox的文件夹下，可以在rest的软件打开report，但是在matlab的command的窗口中却不能打开，跳出如下图，请老师看看具体原因是什么啊？

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