ZangYF Group's CVs

DPARSF2.2运行出错

Submitted by wangkangcheng on Thu, 01/03/2013 - 22:25

刚开始运行就报错。安装的是spm8和rest1.8

??? Error using ==> parallel_function at 598
Error in ==> DPARSFA_run>(parfor body) at 222
Index exceeds matrix dimensions.

Error in ==> DPARSFA_run at 218
    parfor i=1:AutoDataProcessParameter.SubjectNum

Error in ==> DPARSFA>pushbuttonRun_Callback at 1569
    [Error]=DPARSFA_run(handles.Cfg);

Error in ==> gui_mainfcn at 96
        feval(varargin{:});

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Resting-state fMRI topics

time points DPARSFa 2.2

Submitted by ktillisch on Fri, 01/04/2013 - 09:50

I am running a test subject on the newest version 2.2 dparsfa. THe program gives the error at the normalization step:
Moving Normalized Files:A4671_001 OK
Generating the pictures for checking normalization: A4671_001 OK
    'Error in Normalize, time point number doesn't match: A4671_001'

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请教一个关于Alphasim矫正的问题

Submitted by duxue on Fri, 01/04/2013 - 11:18

       请问一下，在rest里面进行alphasim矫正时，如果是自己算，那么FWHM那个地方是按着预处理平滑盒大小来输的吗？比如预处理是8mm，那么这个地方是不是也是8呢？
       另外在选择mask的时候，能否将自己两组单样本的并集mask作为mask呢？（因为一般来说alphasim是基于先验假设进行的一种矫正方法，这个地方的mask应该选择自己假设中的mask，但这样选并集mask有没有问题呢？）
       最后，当我们在选择第一次出现小于0.05的时候，包不包括0.05呢？还是说必须是第一次出现小于0.05的值我们才要呢？
       非常谢谢~~~

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请教一个关于做ALFF低频振幅全脑相关的问题

Submitted by liwenfu on Fri, 01/04/2013 - 14:30

老师好：
    我想将低频振幅的结果和一个问卷得分进行相关，看看是不是大脑自发活动和问卷得分有相关的脑区，方法是SPM中的多元回归，回归掉性别、年龄等因素，有下面几个问题：
      1、选择mALFF-1的数据是否妥当
      2、使用被试3D结构像分割后做成的被试最优灰质Mask作为数据分析的Explicit Mask是否妥当
      3、使用这个Mask从mALFF-1文件中提取每个被试的低频振幅值，作为协变量协变掉是否需要

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REST 软件相关分析

Submitted by moon on Fri, 01/04/2013 - 21:59

老师您好，根据视频中讲的，用REST Correlation Analysis,将功能连接图与一种评分做相关分析，得到R图，请问怎么从这个R图中得到结果呢？比如怎么看哪些脑区的连接强度与评分的相关具有显著性，以及得到这些脑区的信息。盼复，谢谢。

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请教关于DPARSFA_v2.2_Parallel Works报错问题

Submitted by fwd9707 on Fri, 01/04/2013 - 22:20

 我是6核电脑，运行dparsfa时调用4个CPU, 33个功能图像，再完成FunImg和T1Img转换以及去除10个时间点后，报错如下；盼老师予以解答，万分感谢！Configuration:

  Crash Decoding  : Disabled
  Default Encoding: GBK
  MATLAB Root     : C:\Program Files\MATLAB\R2012a
  MATLAB Version  : 7.14.0.739 (R2012a)
  Operating System: Microsoft Windows 7
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DPARSF outputs/results for second level analyses

Submitted by tsheng75 on Sat, 01/05/2013 - 08:02

 Hi guys,

I am a relatively new user of DPARSF/A and I am wondering which output/results files are the most appropriate to feed into second level group analyses? For example, does one use the 'ALFFmap', 'mALFFmap', or 'zALFFmap' files from each individual subject for a group-level t-test or regression? Some of the online documentation (albeit for previous versions of DPARSF) seem to suggest using the 'm' or 'z' files, but is that appropriate? In task-based fMRI, the con* images are fed into second level (and they are neither mean-normed nor z-scored). Please advise, thanks!

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咨询一个Slice viewer和Xjview相同P值下T值不一样的情况

Submitted by liwenfu on Sun, 01/06/2013 - 20:41

老师您好：
请教一个在Slice viewer和Xjview中相同P值下T值不一样的情况：
我的数据是结构像数据，数据是1.5 X 1.5 X 1.5的，分析被试的灰质体积和问卷得分的相关，方法是在SPM中进行多元回归分析，得到的spmT_0001使用Xjview打开，设置p value=0.005，此时的T=2.8784，然后我使用Slice Viewer打开spmT_0001文件，设置p=0.005，此时的T=3.1966。两个软件输入相同的p值对应的T值不一致，不知道是什么原因。

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