ZangYF Group's CVs

关于SPM与DPARSFA 里的mask及个疑问

 各位老师好!
1、我在使用DPARSFA、REST等处理数据时,发现其中自带的Mask有这两种规格:91×109×91(voxel size=-2×2×2),、61×73×61(voxel=-3×3×3);而SPM8里面priori文件夹里只有91×109×91(voxel size=-2×2×2)。看到视频是讲解说DPARSFA、REST等用的Default Mask用的是SPM5先验模板threshold at 50%后的mask,请问这个mask就是61×73×61(voxel=-3×3×3)吗?

请教how to make “a 'mask' figure ”

      老师您好,我们课题的合作者说“we need a 'mask' figure to show that the resting fmRI acquisition covered most of the medal prefrontal regions”,不知道这个具体是什么意思,请教老师这个应该从哪方面进行处理呢?

About the "Ch2 Bet" template in rest slice viewer

  Dear teachers: I have a question about the rest slice viewer.After calculating the FC data,I wan to use the "Ch2 Bet" as the underlay template.But the image of sagittal view ( x=1)is incompleted(As shown in the figure).How should I solve this problem?Looking forward to hearing from you.Than you very much.

Error in Realign

Hello,

I am extremely new to using the DPARSF software.

I am trying to preprocess my resting-state fMRI data and can get DPARSF to begin this, but it will only work for a while until I get this error message: 

Moving Realign Parameters:Sub_4982 OK

    'Error in Realign: Sub_4982'

 

Any ideas why this might be? I have tried it on two different subjects and each time this message comes up. 

Many thanks in advance, 

Kelly 

一个SPM问题:在任务态数据二阶中分析最后的results阶段,FDR/输入P value后就卡死了,请师兄老师指教

    二阶分析做得是配对t检验,因为是第一次用SPM做二阶分析,所以我用4个被试的数据练习了一下。下面是二阶分析中生成的设计矩zhen

Forums: 

Rest中,相关函数有点问题,需要使用的,可暂时参考本贴修改

大家好,
          Rest calculate中的计算temporal 相关的函数有问题,下次升级就会改进,现在需要做temporal 相关分析的,可以修改rest_TwoGroupCorr.m文件中的函数“temcorr(Group1Dir,Group2Dir,outdir)”。即将rest_TwoGroupCorr文件中74行的for i=1:nVolumn替换为    for i=1:size(Group1Series,1)即可。

ICA后续相关性分析的疑问

 各位老师好:
        我利用MICA软件提取了DMN网络。现在观察患者每个DMN 的功能连接异常区域是否和患者预后评分有关系。对于每个DMN ,先在双样本t- 检验的结果中提取出患者相比正常对照降低的脑区(P<0.05,AlphaSim校正),作为ROIs。然后应用REST里的Extract ROI Signals工具提取ROI Singals,但是运行时出现以下错误提示,小弟非工科,看不懂代码,恳请老师指点,不胜感激!