ZangYF Group's CVs

经过VBM预处理和双样本t检验以后，想要利用统计出来的正负激活簇作为ROI来计算被试的这些ROI的体积，但是中间和后面出现了一系列问题

Submitted by ilovec on Wed, 12/17/2014 - 22:10

如题所示，我完全是这方面的小白，现在想要提取一些参数作为区分AD和NL，我手上只有结构型的MRI，所以用spm,rest这类工具有点茫然

现在我先是 通过VBM预处理，就是按照范丰梅写的那个《VBM处理流程-PDF》来的，经过了normalizing和segmenting，其中有的部分因为spm8和spm5有不同，所以我除了针对AD的预处理是thorough cleanup之外其他都是默认选项，比如那个high-demensional DATREL模板，最后使用了FWHM[8 8 8]的高斯平滑。

然后我选择了smwrp1*.nii这些文件用spm进行了双样本t检验，操作仍是参照范丰梅写的那个《VBM处理流程-PDF》.

Forums: 
Other

DPARSFA回归WM，GM，CSF时生成的mask与Realign得到的图像的坐标不一致

Submitted by loveH on Thu, 12/18/2014 - 09:38

老师：
您好！
我用DPARSFA对静息态的数据进行预处理，顺序是：SliceTiming-Realign-T1Segment-Nuisance Covariates Regression-Mormalize.遇到了两个问题：
1.我发现Nuisance Covariates Regression的时候生成的某些被试的白质、灰质、脑脊液、全脑信号mask的坐标位置与realign得到的图像的坐标位置有差异。如图（左侧为realignParameter文件夹内的图像，右侧为Masks中BrainMask图像，用MRIcro显示的同一坐标位置的截图）：

Forums: 
Resting-state fMRI topics

DPARSF报错

Submitted by Duoning on Fri, 12/19/2014 - 15:27

数据整理没有问题一直报错如下，是怎么回事？
??? Index exceeds matrix dimensions.

 
Error in ==> DPARSFA_run>(parfor body) at 2224
        MeanFilename =
        [AutoDataProcessParameter.DataProcessDir,filesep,'RealignParameter',filesep,AutoDataProcessParameter.SubjectID{i},filesep,DirMean(1).name];
Forums: 
Resting-state fMRI topics
more