ZangYF Group's CVs | Forum of resting-state fMRI

REST1.8 voxel wise相关报错

Submitted by wujingxi on Fri, 05/12/2017 - 18:16

各位专家，我想做某行为指标和大脑计算结果的voxel-wise相关，用到了REST1.8里面的Statistical Anlysis插件，在REST CorrelationAnalysis中进行，ADD Group Image和ADD Text Covariates后，报错如下，至今解决不了，请大家帮忙。

.......??? Attempted to access r(1,2); index out of bounds because

numel(r)=1.

Error in ==> rest_corr_Image at 84

rCorr(i,j,k)=r(1,2);

Error in ==> rest_corr_gui>btnCompute_Callback at 158

rest_corr_Image(DependentDirs,SeedSeries,OutputName,...

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ALFF计算结果三种文件及组分析文件选择

Submitted by wujingxi on Wed, 05/17/2017 - 11:29

用DPARSF做ALFF，得到三种文件ALFF，mALFF和zALFF，对于这三个文件，我的理解：

1）ALFF文件是直接对时间序列取功率谱，得到的为正值

2）mALFF文件是ALFF文件除以全脑均值得到，为正值

3）zALFF文件是ALFF文件减去全脑均值后/标准差，会有正值和负值

请问各位，我的问题：

1. 对于三种文件的理解是否正确？

2.用哪个文件进行Two-sample T的分析较好？

3.如果做ALFF和某个行为指标的相关，ALFF,mALFF和zALFF文件应该选择哪个？

4.如果对ALFF做ONE SAMPLE T检验的话，应该选哪个文件？（我记得以前是选择ALFF-1文件，但是现在没有ALFF-1文件了）

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关于Permutation test 的报错

Submitted by fruitfly on Thu, 05/18/2017 - 20:50

各位老师，您好：

我在进行Permutation test时MATLAB报错，报错如下：

Reading images from "F:\FC data\Fun_preprocessdata\adult\control\ROI7\zROI7FCMap_24.nii" etc.

Undefined function 'file2mat' for input arguments of type 'struct'.

Error in file_array/subsref>subfun (line 80)

t = file2mat(sobj,varargin{:});

Error in file_array/subsref (line 60)

t = subfun(sobj,args{:});

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功能网路运行错误

Submitted by ben on Sun, 06/04/2017 - 22:54

各位老师您好:

我在执行functional connectivity的运行出错,报错如下：

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关于asl分析的一个问题

Submitted by jinyi on Fri, 06/09/2017 - 16:21

求问一个关于ASL的问题

最近打算应用已经做好的一批asl数据，但是问题来了，这边给我的数据是从核磁室复制出来的dicom文件，有两个序列，核磁室技术员并不知道含义，只是按照参数做出来。因为以前并未接触过asl相关，我不知道这些东西是计算好的CBF图，还是原始数据。如果是原始数据，到底哪些是计算用的，哪些是参照的M0呢。

核磁机器是GE 750，应该是3d asl

谢谢大家指教

附上附件，其中是完整的NifTl文件

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