ZangYF Group's CVs

REST1.8 voxel wise相关报错

各位专家,我想做某行为指标和大脑计算结果的voxel-wise相关,用到了REST1.8里面的Statistical Anlysis插件,在REST CorrelationAnalysis中进行,ADD Group Image和ADD Text Covariates后,报错如下,至今解决不了,请大家帮忙。

.......??? Attempted to access r(1,2); index out of bounds because

numel(r)=1.

 

Error in ==> rest_corr_Image at 84

                    rCorr(i,j,k)=r(1,2);

 

Error in ==> rest_corr_gui>btnCompute_Callback at 158

rest_corr_Image(DependentDirs,SeedSeries,OutputName,...

ALFF计算结果三种文件及组分析文件选择

用DPARSF做ALFF,得到三种文件ALFF,mALFF和zALFF,对于这三个文件,我的理解:

1)ALFF文件是直接对时间序列取功率谱,得到的为正值

2)mALFF文件是ALFF文件除以全脑均值得到,为正值

3)zALFF文件是ALFF文件减去全脑均值后/标准差,会有正值和负值

请问各位,我的问题:

1. 对于三种文件的理解是否正确?

2.用哪个文件进行Two-sample T的分析较好?

3.如果做ALFF和某个行为指标的相关,ALFF,mALFF和zALFF文件应该选择哪个?

4.如果对ALFF做ONE SAMPLE T检验的话,应该选哪个文件?(我记得以前是选择ALFF-1文件,但是现在没有ALFF-1文件了)

关于Permutation test 的报错

各位老师,您好:

     我在进行Permutation test时MATLAB报错,报错如下:

     Reading images from "F:\FC data\Fun_preprocessdata\adult\control\ROI7\zROI7FCMap_24.nii" etc.

Undefined function 'file2mat' for input arguments of type 'struct'.

 

Error in file_array/subsref>subfun (line 80)

t = file2mat(sobj,varargin{:});

 

Error in file_array/subsref (line 60)

    t = subfun(sobj,args{:});

 

关于asl分析的一个问题

求问一个关于ASL的问题

最近打算应用已经做好的一批asl数据,但是问题来了,这边给我的数据是从核磁室复制出来的dicom文件,有两个序列,核磁室技术员并不知道含义,只是按照参数做出来。因为以前并未接触过asl相关,我不知道这些东西是计算好的CBF图,还是原始数据。如果是原始数据,到底哪些是计算用的,哪些是参照的M0呢。

核磁机器是GE 750,应该是3d asl

谢谢大家指教

附上附件,其中是完整的NifTl文件

 

DPABI进行ALFF分析完成后进行滤波,Filter生成的文件是对ALFF/fALFF的哪个文件进行的分析?

老师,您好。我在用DPARSF4.1 ADVANCE版进行ALFF的分析,ALFF分析完之后进行了滤波。我有几点疑惑:

1. Filter这一步是对Results中ALFF/mALFF/zALFF/fALFF/fmALFF/fzALFF中的哪一个文件进行操作的?

2. 在做所有被试的ALFF或者fALFF统计的时候应该用哪个文件?是Filter之后生成的Filtered_4DVolume文件还是Results中的某一个文件?

谢谢!

关于使用DARTEL做标准化的问题

各位老师,我在使用DPABI做标准化时使用的Normalize+DARTEL,发现标准化后的图像匹配的并不是很好,重新调整跑了好几次,总是发现标准化后的图样跳的很离谱(如图),但是用EPI templates就不会出现这个现象,不知道是什么原因怎么解决?

Error | Forum of resting-state fMRI

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