ZangYF Group's CVs

ER设计的数据用DPARSF做功能连接分析

Submitted by luxueming on Fri, 11/18/2011 - 12:49

大家好，

我现在想要对一组ER设计的数据用DPARSF做功能连接分析。在阅读相关文献时，我注意到很多使用任务激活数据做连接的研究中，都将实验设计的条件回归掉
如：The task-related regressor
(tactile or visual moving stimuli) of each run was also included as
an additional regressor of no interest in the correlation analysis in
order to minimize the effect of the specific tasks (Whalley et al.,
2005) ----- Sani et al, 2010

Functional Connectivity with multiple subjects?

Submitted by Chris Stevens on Sat, 11/19/2011 - 05:29

Hello, I'm a new user of REST and I'm trying to use the functional connectivity tool with multiple subject's data. I followed the instructions provided in the documentation but I have a question about inputting multiple subject's folders. What I did was selected one subject's folder containing their nifti pair data set. Then added another directory to the input list containing another subject's data folder.

关于rest工具箱里的reho.m

Submitted by Lighthawk on Mon, 11/21/2011 - 21:14

老师、学长好~ 请教个问题
在使用 REST_V1.5_101101 这个工具包后，自己根据定义写了一个计算reho的代码。即对每个体素的所有时间点直接升序sort，然后计算KCC值。没有加入任何优化。但计算出来的结果，每个体素的reho值普遍比工具箱里算的值相对偏小。模糊可以看到，自己算的图像黑白的区域与工具箱的结果是很相似的。
回头看工具箱里的代码时，发现reho.m计算rank时取了平均，注释写的是"Compute mean of tied ranks"。
我的问题是：
1、tied ranks是什么意思啊？
2、为什么不直接用[result, Index] = sort(matrix) 里的Index，而自己重新写了一个rank呢？
3、reho.m里的处理方法比原定义的方法有什么优点吗？
谢谢老师、学长回复哈~~

本周二（2011.11.22）组会

Submitted by jwb on Tue, 11/22/2011 - 08:54

大家好！11月22日（周二）晚上七点的组会由研一学生原彬科汇报。汇报的内容是三种配准备方法（SPM2-type,SPM-DARTLE,HAMMER）.

附件是汇报会涉及的两篇文献。第一篇涉及到了前两种方法，第二篇涉及到第三种。有兴趣的老师和同学可以参看。

与参加组会的同仁可以于晚上6点50分通过Skype呼叫 wenbinjia.08@mail.com，这样就可以通过语音参加组会了。

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想請問發生什麼事（用dparsfa做normalization出問題）

Submitted by louislin28 on Tue, 11/22/2011 - 18:34

我的軟體是matlab 2010a
DPARSF advanced
錯誤碼：

Moving Head Motion Corrected Files:Subject001 OKMoving Head Motion Corrected Files:Subject002 OKMoving Head Motion Corrected Files:Subject003 OK
??? Error using ==> cd
Cannot CD to /Users/mac/RestingfMRI/DataAnalysis/T1Img (Name is nonexistent or not a directory).

Error in ==> DPARSFA_run at 456

ReHo处理结果 很多部分在脑壳外

Submitted by wujingxi on Wed, 11/23/2011 - 11:01

您好：
我用ReHo对我的数据进行分析，预处理利用REST工具包进行，统计分析two sample T， 发现达到阈值的结果很多在脑壳外面(MRIcro+Che2bet模板)，请问为什么？ 这样会不会把有用信息剔除掉？对于脑外的部分如何处理？

谢谢

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