Hello,
We´ve been using REST to analyse resting state scans.
First we did it following the indications of the presentation, using a mask for the ROI and a mask for the brain.
Well, we finally obtained the default mode networks, as expected.
各位老师好，我在制图的时候遇到以下几个问题，想请教一下各位老师，非常感谢！
1、我们知道AAL模板有90个区域，我计算了每个区域的某个属性值，比如说中央度，我计算出了中央度最大的5个区后，在rest的Slice View里把这5个区Save Clusters了，得到了一个.img和一个.hdr文件。可是在显示这个文件的时候，颜色是按这5个区的Labal值显示的。如果我希望这5个区域的颜色显示的是我计算出来的中央度，需要怎么做？
2、我把正常人中央度显著大于AD患者的区域做了一个图，又把AD患者中央度显著大于正常人的区域做了一张图，怎么把这两张图叠加在一起，并且使AD>Nor的显示红色，Nor>AD的显示蓝色？
大家好！请问regressor这个词应该怎么理解啊？我最近在很多地方都看到这个词，请大家不吝赐教。
在SPM8的manual里第62页讲到1st level analysis的Timing parameters设置时，提到“Also, with long TRs you may want to shift the regressors so that they are aligned to a particular slice. This is e ected by changing the microtime resolution and onset.”
第63页的fig8.2也提到了这个词，图如下：
严老师：
我现在有一批病人的数据，是BLOCK-DESIGN设计，请问可以构建全脑网络吗？为什么都没看见用任务数据做复杂网络分析？
想请问老师几个比较基础的问题：
1、就是如上图的统计结果表格，各列都是什么意义（最后还差一列贴图没显示全，个人觉得应该是各个cluster的峰值点的坐标）；
2、Z值是什么意思，如何求得；
3、现在能够知道激活的cluser在各个脑区的像素是多少，是否还能求激活的强度呢。谢谢
老师，您好
用Rest做fC,我遇到坐标问题，得出的结果图像与原始图像以及mask不一致（x坐标上有位移，并且x轴上的起始坐标不一致）。
如下：
restFMRI_1 是处理好的fmri数据。我用rest做ROI Center(mm)=(-5.500000e+00, -31, 1.150000e+01); Radius=1.50 mm， 与全脑的功能连接
mask 全脑的mask
FCMaps_result 得到的结果。
可以看到，restFMRI_1 和 mask 的坐标以及原点是一致的，可是得到的FCMaps在x坐标上有位移，并且x轴上的起始坐标不一致。
这是怎么导致的，有没有办法解决。
另外，对于我定义的ROI，Rest在计算时，会不会四舍五入，把ROI变成 (-6,-31,12); R=2mm ???
各位老师，新年快乐。
对于rest统计我有一个疑问：
假设我有10个被试，每个被试有6个session的resting fmri，每个session是5分钟的扫描。
现在我用PCC做ROI与全脑做功能连接，于是就会得到 10个被试*6个session = 60个 zFCMaps.
现在我想看PCC与哪些区域有显著的功能连接，我是不是可以直接拿这60个zFCMaps做one sample t test?
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但是我看一些文献，好像在统计做了区分（不知道我理解对不对）：
fix-effect -- 由每个人的6个session的zFCMaps来得到每个人的map， 这样60个zFCMaps就变成了10个maps ????这个过程不需要由样本推测总体？？
mix-effect -- 由每个人的maps得到总体的maps，这样10个maps就变成了我想要的一个map ??? 这个过程是由样本推测总体 ，所以在统计时的一些参数和上面不一样？？
这个概念我一直不是很清楚，我一直就是用rest的one sample t test来处理，没分什么fix-effect和mix-effect。
严老师：
您好。我根据您的视频做了三个正常人的REHO及ALFF，顺便试着做了个单样本t检验，得出的图像出现了蓝色的激活区，而且在脑室里也有激活的存在。现在的问题是1、为什么会出现负激活，这个要怎么解释？2、脑室出现激活，是因为我的病例数太少，统计学误差还是因为在数据处理过程中有问题？谢谢您。
The REST toolbox is coded as follows;
" Covariables Polort (Polynomial Orthogonal Degree): 0 "
Is it right? I think this code can't regress out covariables because '0' means not to use this function.
Please comments.
What number is right for covariables polort?
严师兄，请教你个问题，我在用vbm处理3D图像过程中的问题：在check data quality=>display one slice for all images 时用默认的参数是总是错，运行不下去是为什么？Proportional scaling：选yes或no都运行了，Show slice in mm选的默认值0。谢谢！