December 2011

Regarding analysis

Submitted by Neeraj Upadhyay on Wed, 12/28/2011 - 12:33

Dear all,
I am a beginner of DPARSF. when I was analyzing my data found an error in mapping functional connectivity .Please tell me about the procedure using REST how I can make the Covariate list to regress out nuissance covariates.
One more query regarding T1Raw analysis what parameters we have to set for T1 images analysis.

Forums: 
Resting-state fMRI topics

height extent correction

Submitted by liufeng on Wed, 12/28/2011 - 09:23

管理员好：
最近看文章很多是用height和extent校正的，也是用一个p值和一个cluster size，问下这个是不是和alphasim差不多或者就是指的alphasim呢？我记得ni上可能02年左右有一篇文章是专门介绍这个校正的原理的，不过具体操作也没有说。

这个校正该如何实现呢？用什么软件呢？或者extent这个cluster应该如何定义比较合理呢？

谢谢！

Forums: 
Resting-state fMRI topics

老师，想请教您2个关于ALFF的问题

Submitted by cappuccinoxt on Tue, 12/27/2011 - 20:34

老师，你好！
我现在在学习ALFF，在数据处理过程中遇到了一些问题，希望得到答案。谢谢您答疑解惑。
1. 被试数据扫描时间不同，在一次扫描过程中，有的被试是185volumes，而有的是200volumes。臧老师07年发的Brain Development文章中在遇到此类问题时的处理办法是：将具有200个volumes的被试的最后15个volumes去除，将所有被试的volume数保持相同，都为185volumes，然后进行下一步的分析。我想问的是，不去除这15个volumes可以嘛直接计算每个个体的ALFF map可以嘛？如果必须去除，原因又是什么？

Forums: 
Resting-state fMRI topics

DPARSFA 出错

Submitted by yubing on Mon, 12/26/2011 - 18:59

Win XP ,Matlab 7.01 ,SPM5 ,REST 1.6

处理示例数据时出错

Read 3D EPI functional images: "H:\fMRI_tang\REST\ProcessingDemoData\test\FunImgARWS\Sub_001".??? Maximum variable size allowed by the program is exceeded.

Error in ==> repmat at 86
B = A(subs{:});

Error in ==> rest_to4d at 63
AllVolume =repmat(AllVolume, [1,1,1, size(ImgFileList,1)]);

Forums: 
Resting-state fMRI topics

不同的TR扫描时间、不同扫描层数的静息态fMRI数据能否在一起分析？

Submitted by cartoon654 on Fri, 12/23/2011 - 08:17

老师您好：
我现在有一些静息态fMRI数据，但有的图像的TR时间和扫描层数和其他的数据不一样，能否将这些数据一起分析？会出现什么样的结果？

Forums: 
Resting-state fMRI topics