Significant clusters
of activation were determined using the joint expected probabil-
ity distribution with height (p < .001) and
extent (p < .001) thresholds, corrected at the whole-brain level.
我们的extent不是体素个数吗？extent (p < .001)是什么意思呢？height (p < .001) 是每个体素的p值吧
本周二继续文献报告：Reducing inter-subject anatomical variation: Effect of normalization method on sensitivity of functional magnetic resonance imaging data analysis in auditory cortex and the superior temporal region。
这篇文献和上周是同一篇文献，主要内容为：SPM2-normalization，SPM5-unified segmentation，SPM5-DARTEL，HAMMER四种配准方法对听觉任务fMRI激活结果的影响，同时也考察了不同配准模板（ICBM152，Colin27,ICBM453）对配准结果的影响及不同配准算法下平滑和不平滑激活结果的差异。
具体文献下载请见上次的通知。
管理员好：
最近遇到了一个问题，我在做两组人（正常人和病人）比如reho的双样本t检验的时候，我将年龄性别作为协变量进行了回归（添加covariates）。我想问下如果两组人分别先进行各自年龄和性别的回归，然后再做双样本t检验时不添加协变量。这两种结果一样不一样呢？
还有一个问题，我双样本t检验添加了协变量，得到差异区域。准备提取差异区域的平均reho值与量表做相关。那么我应该将smreho先进行年龄和性别的回归再提取差异区域的值吧，我认为这样才是合理的。如果直接提取smreho的差异区域的值应该不合理吧？
辛苦了，谢谢。
祝好
请教各位老师：
才看见有人指出不能用SPM转格式，因导入的图像是2D的，非3D，不能用于fMRI分析，是这样么？我之前没注意这个问题，用了SPM的DICOM IMPORT功能，并且后续一直都能做。本来一开始用REST将我、原始文件分类，但发现文件顺序还是跟光盘上的顺序一致，是按扫描顺序排列的，如T1相便是1、3、5、7...而用SPM转的话，T1相就是按层数的顺序1、2、3、4...这样排列了。
另：若是用MRIcron转格式的话能自动排序么？如何操作呢？
版主好：
请教一个问题，在我看种子区域到全脑算功能连接的文章一般是这么做的。将预处理的静息态数据（时间头动校正配准去漂移滤波），提取出种子区域的平均时间序列，然后进行回归头动、全脑信号、白质、脑脊液信号，然后把全脑每一道信号也进行回归处理，最后算时间序列的相关。
我感觉dparsf是这样做的，预处理后（filter后），先把全脑每个体素的时间序列进行回归头动、全脑信号、白质、脑脊液信号，然后提取出种子区域的时间序列，和全脑其他每一个体素算相关。因为我在dparsf做fc的时候让我选择回归后的文件夹，即covmoved文件夹。
我想问下，这两种不同的方法，得出的结果一样吗？哪个好一些呢？简单说来，这两种方法就是先提种子区域时间序列再回归和先回归再提种子区域时间序列的问题。
麻烦版主了，谢谢。
各位老师好，我是一名初学者，进行感音神经耳聋的研究。现在双样本检验后，得到T值，用REST SLICE VIEW进行图像显示，ALPHASIM校正中，当RMM=4时，XJVIEW显示有18个CLUSTER;RMM=5时有11个，RMM=6时有7个。不是说RMM=4时是面对面的方法，校正更严格，怎么CLUSTER还最多？？再有我应该用哪个RMM值？另外，怎么用XJVIEW的报告制做表格，一个CLUSTER中有很多个脑区（从多到少的VOXEL）选哪几个呢？多谢，多谢！！
最近看文献，只知道vbm经过modulate后是volume，不经过modulate是的density，不过具体表示了什么还不是很清楚。而且为什么经过modulate就是体积也不是太清楚。下面一段话是文章中的，没太理解，请指点下，谢谢。还有，用哪一个指标比较好也没有具体的说法吧（体积还是密度？），是不是喜欢用哪种就用哪种？有没有什么经验呢？
本周二汇报的文献：Reducing inter-subject anatomical variation: Effect of normalization method on sensitivity of functional magnetic resonance imaging data analysis in auditory cortex and the superior temporal region，详见附件。
这篇文献主要内容：SPM2-normalization，SPM5-unified segmentation，SPM5-DARTEL，HAMMER四种配准方法对听觉任务fMRI激活结果的影响，同时也考察了不同配准模板（ICBM152，Colin27,ICBM453）对配准结果的影响及不同配准算法下平滑和不平滑激活结果的差异。
I have used SPM to preprocesses my data before using the REST utility to convert the data from .nii to niftiPairs. But I am now running into problems and I receive errors and warnings in many of REST's tools about the dimensions of my images. Here are all the problems I've encountered: