May 2012

DPARSF 出错

系统
 XINXP , Matlab2011b, REST 1.7, DEPARSF 2.1

出错内容如下,多谢指教!

Undefined function 'cfg_util' for input arguments of type 'cell'.

Error in spm_jobman (line 205)
            cjob = cfg_util('initjob', mljob);

Error in DPARSF_run (line 365)

关于静息态研究中样本量计算问题

请教各位老师:

如果想发现A,B两组存在可靠的静息态参量(例如:smReHo,malff等)差异区域,那么在实验设计中如何确定A,B两组患者的样本量呢?我记得在统计学上有计算病例-对照研究以及队列研究样本量计算的公式,但是如何将其移植到用于磁共振的单样本统计分析、双样本统计分析以及方差分析中,找出适合这三种分析的样本量计算公式呢?
 

about ICA 报错

老师:
     您好!
    我在运行ICA时,使用的是两组被试做对照,每组25例,设定运行次数50(之前用了100次报错说内存不够所以选用了50次)、自动估计成分,最后运行结束时,我想看所有被试的相同成分例如第26个成分,总是报错(如下示),不知道是什么原因,如果想提取(extract)这个成分出来,还是报错,麻烦老师您帮我看看,谢谢!

观察所有被试某个相同成分时报错:
Warning: Calling MEX-file

BA分区与标准化坐标分区问题

老师,您好!我的大论文的盲评专家提的意见看不懂,不晓得什么意思,请教老师。
表6的研究结果中,阐述了艾灸前后ReHo值变化的脑区,采用了BA分区,但是在实验方法中却没有提及如何对FMRI扫描获得的功能磁共振图像进行标准化的坐标化分区

Artifacts

Dear experts,
I ran the DPARSF preprocessing steps on a set of fMRI subjects, and I obtained images with parallel streaks which didn't look right. I am enclosing an example image. Has anyone encountered a similar issue?
Could one reason be that there was radio frequency leakage, as one book suggests? Or could it be the settings of DPARSF that I need to modify?

Thanks!

Forums: 

关于结果(report)

老师:
      您好!
      我在做双样本T检验时,有些负激活的脑区在小脑的边缘,不在脑实质,有的甚至都跑到四脑室里了,我看report在定位峰值区是也是用的undefined,请问这些区域有没有讨论的意义呢,造成这样的原因会是怎样的呢?
     谢谢!

DMN文献阅读问题

在阅读一篇癫痫默认状态网络的文献中产生了一些问题,望指教,谢谢大家的耐心与时间!
Paper:Altered Functional Connectivity in Default Mode Network in Absence Epilepsy: A Resting-State fMRI Study.
目的:观察癫痫DMN及其内部区域间功能连接的改变。
Data analysis:
1、 DMN Identification: 以PCC的功能连接pattern来定义DMN。

脑亚区功能连接

各位老师,我在关注脑亚区功能连接的文献中,遇到了一些问题,望建议,多谢!
以一篇文献为例:
Bai et al. Aberrant Hippocampal Subregion Networks Associated with the Classifications of aMCI Subjects: A Longitudinal Resting-State Study. Plos one. 2011.
先简要介绍一下该研究:

请教关于DPARSF和REST读取数据次序的问题

各位老师好!
学生有几个问题,想请教各位老师:
1.请问DPARSF和REST软件在读取数据的时候是按照sub1,sub11,sub12,sub2,sub3,sub4,sub5,sub6,sub7,sub8,sub9的次序,还是从sub1~sub12递增的次序呢?
2.那在读取文本文档的时候,次序是按照文档中数据的先后次序吗?
3.在对ALFF做组分析,尤其是配对t检验的时候,取平均的ALFF是不是忽略了全脑信号各自的平均水平呢?虽然平均的ALFF看起来似乎做了标准化的处理,可能更符合正态分布,但是却忽略了两组数据全脑信号的平均水平,这样合理吗?
谢谢老师!