December 2013

error occur using DPARSFA

Submitted by YYW on Tue, 12/31/2013 - 17:04

thank you so much for the great tool!!!!

i really appreciate your effort!!

while using DPARSF_V2.3_130615

error occured

it says

Undefined function 'rest_ReadNiftiImage' for input arguments of type 'char'.

Error in y_FD_Jenkinson (line 31)
[RefData, RefHead] = rest_ReadNiftiImage(ReferenceImage,1);

Error in DPARSFA_run (line 858)
FD_Jenkinson = y_FD_Jenkinson(rpname.name,RefFile);

Error in DPARSFA>pushbuttonRun_Callback (line 1601)
[Error]=DPARSFA_run(handles.Cfg);

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regress covariates of age

Submitted by szjoanna7 on Mon, 12/30/2013 - 11:54

老师们好，
我现在有两组年龄相差较为显著的数据，想去除这个年龄的协变量。我知道在two-sample t-test的时候可以加入txt去除协变量，如果我做功能连接呢？在功能连接之前如何可以去除这两组的年龄协变量？DPARSF只可以加入图像的协变量，而REST我注意到是一次只能加一个，怎样可以同时加入这两组的年龄txt去除协变量？烦请老师们解答下，谢谢。

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DPARSFA的运行问题

Submitted by Learner--ECNU on Sun, 12/29/2013 - 18:24

 各位老好：
        我把路径文件参数设置好后，运行DPARSFA老是报错这个信息：
      Error using file_array/subsref>subfun (line 80)

Undefined function 'file2mat' for input arguments of type 'struct'.
 
Error in file_array/subsref (line 60)
    t = subfun(sobj,args{:});
 

脑区翻转问题

Submitted by Learner--ECNU on Fri, 12/27/2013 - 17:38

 老师好！ 我现在手上有批病人数据，总的数据量还是挺多的，但是这些病人的病灶区不是都在同一侧，分成左右病灶组的话被试的数量就不多了，我现在研究的一个功能区并没有偏侧性，所以我想把这些病人的病灶人为地翻转，使它们在同一侧，之前好像看过一篇文献里提过这种技术但是没细讲实现过程，请问各位老师有什么软件可以做这个或者有什么经典文献？万分感谢啊！！

请教功能连接可以只有正的结果么

Submitted by taofly on Fri, 12/27/2013 - 16:28

请教老师采用怎样的预处理或方法能够使静息态的功能连接的结果只有正值没有负值呢，我试了不去除全脑平均协变量，还是有负值。如果两个脑区的连接值是负值，那负值的绝对值越大，能说明功能连接越小么，谢谢老师！
还有gca的基于系数的结果有正有负，负的是说明抑制么，从-1变成-2是说明抑制作用增加么，谢谢老师！

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关于AlphaSim校正所用的FWHM到底该用预处理时的平滑核还是用SPM生成的统计图（con .img/spmT .img）估计出的平滑核?

Submitted by floyd on Thu, 12/26/2013 - 11:50

各位老师，在下的问题如题目中所言：
关于AlphaSim校正所用的FWHM到底该用预处理时的平滑核还是用SPM生成的统计图（con .img/spmT .img）估计出的平滑核?
在下处理任务态fMRI的结果时，如果用预处理的平滑核FWHM=8，则结果有较多激活。
但若用REST的AlphaSim软件估计出的平滑核，则要大很多（且此值和SPM生成的全脑报表中的FWHM大小一致，17.5，17.2，17.2），如果按此值来做校正，则无显著激活存留。
在下翻遍了之前此论坛的帖子，未发现有明确说明此问题或给出明确答案的帖子。到底该用哪个平滑核呢？？？？？
在下疑惑万分，心急如焚，还请各位老师不吝赐教！

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