rest是否可以做结构态

Submitted by fish on Sat, 12/28/2013 - 14:02

老师：
       我想问rest主流是做静息态，但是是否可以做结构像的后续处理呢？比如双侧t检验，并提取平均值？

Submitted by fish on Sun, 12/29/2013 - 15:11

谢谢老师，我还想问因为用DARTEL做完后，发现在spm的成像中显示voxel有部分在脑袋外面，是不是因为用DARTEL做的voxel是1.5x1.5x1.5，而spm只有1x1x1?这个问题在REST中是否存在？是否需要reslice呢？

Submitted by ZHANG_RESTadmin on Sun, 12/29/2013 - 18:30

 不需要reslice，在脑外不在脑外你是怎么评估的？dartel也不一定做的很准，一点脑外是正常的。总的来说效果还是不错的。

Submitted by fish on Sun, 12/29/2013 - 23:25

当时为的是想看voxel大概有多少，就用的是spm做的，没有校正，直接用p<0.01，结果发现voxel比脑袋大了一倍半。之前有人也出现过这种情况，后来他说用REST的reslice image，重新校正为【1 1 1 】就可以了（不过我尝试了后没有成功）。有人认为是在Normalise to MNI Space 的过程中， Gaussian FWHM 设置的是 8，这个值可能偏大，所以才导致voxel和图像不匹配。具体原因我也不是很明白。希望老师指点迷津

Submitted by ZHANG_RESTadmin on Mon, 12/30/2013 - 09:30

 voxel比脑袋大？我没有看懂。 大了一倍半？你怎么测量出来的？
Gaussian FWHM 设置的是 8 这个没有问题。
voxel和图像不匹配是什么意思？

从你描述的话，因为好多用词不准，我很难知道问题在哪儿。
最好贴出图来看看。

如果你是说做完spm统计以后，t图比标准脑模板大了一圈，这是因为平滑造成的，你应该把你的t图再卡一个全脑模板（用image calculator，表达式写i1.*i2）

Submitted by fish on Wed, 01/01/2014 - 22:30

老师：我不明白的是t图再卡一个全脑模板中i1 和 i2 分别代表什么，而且我后来又用vbm8做了一遍，双样本t检验做出来的t图依然很大，用rest slice viewer显示需要reslice，我想可能我在用DARTEL和VBM处理时应该犯得是同一个错误，但不知道是哪一步错了

Submitted by ZHANG_RESTadmin on Wed, 01/08/2014 - 17:01

 可能你用spm 的vbm做的配准分割之类的工作，但是spm里用了比较小的bounding box，REST里用了较大的bounding box。

你可以用xjview去看结果试试。