May 2014

关于atlas体素大小的问题

请问各位老师,如何将标准atlas voxel为2mmx2mmx2mm的模板转为3mmx3mmx3mm的呢?rest包里虽然有brodmann和aal61x73x61的,但是我想使用更多的模板。FSL中有很多自带的atlas模板,但voxel size都是2x2x2的,而我的数据是3x3x3的,怎么才能将这些模板转为体素大小3x3x3可用的呢?谢谢各位老师啦!

For statistics

臧老师及各位老师:
      您好!
      我有一组病人和一组正常人,都做了A、B、C、D、E问卷,这些问卷之间可能互相存在关联。在做低频振幅的时候,我将病人根据性别分为男、女组,根据治疗与否,分为治疗组及未治疗组,正常人根据年龄、性别选择1:1匹配。所有病人-正常人得到结果P1,P2,P3;女性病人-女性正常人得到结果F1,F2;男性病人-男性正常人得到M1,M2;治疗组-正常人得到结果Treat1,Treat2;未治疗组-正常人得到结果UntTreat1。
        根据这种情况, 统计分析应如何进行?以下哪种更合适?

关于REST软件中AlphaSim矫正设置问题

 老师好:
      REST中的统计做的双侧检验,而SPM做的单侧检验,在使用REST和Xjview看结果图的时候,它们的p值之间有个倍数关系,REST的p值要设成Xjview的一半。
     我想问下如果要在两个软件中实现相同阈值的AlphaSim矫正的话,这两个软件此时的P值还是不一样?REST软件中计算那个AlphaSim矫正表还能用在Xjview中吗,需要做修改吗?

请教高手帮忙看看这个统计分析。

T2-34 P=0.01 T=2.8188

This report is based on CUI Xu's xjview. (http://www.alivelearn.net/xjview/)

Revised by YAN Chao-Gan and ZHU Wei-Xuan 20091108: suitable for different Cluster Connectivity Criterion: surface connected, edge connected, corner connected.

Number of clusters found: 11

统计分析时cluster是否需要相加啊?

 各位老师好,我现在统计分析遇到几个问题,如下

Cluster 10

Number of voxels: 30

Peak MNI coordinate: 0 -15  60

Peak MNI coordinate region:  // Inter-Hemispheric // undefined // undefined // undefined // undefined // Supp_Motor_Area_L (aal)

Peak intensity: -3.3641

关于overlay的问题

 各位老师好,之前没怎么注意这个overlay到底选什么,现在看了一下视频,overlay选的是××××.img。。。。但是我统计的时候一直用的是××××.nii,请问这有什么不同吗?好像我统计生成的结果就是只有.nii文件,没看到.img文件啊。。。不知道这样可不可行,谢谢各位老师的回答。

多元GCA

 老师,
您好,做GCA分析时,选择的数据是不是做完平滑和滤波之后的.nii文件,在FunImgARCWSF文件夹中?
我计算了几个ROI的多元GCA,结果出现两个文件order1和order2,请问这两个文件应该怎么使用,需要用哪个?
谢谢老师指点~

Matlab2012a上运行DPARSF2.3可以吗?

 严老师您好:
       我用的是Mathwork.Matlab.2012a,然后下载了SPM8,Rest1.8,DPARSF2.3,在运行DPARSF处理BoldS数据时,刚做完remove first 10 time points就报错了,错误代码如下,我试了几次都是一样的错误,能请您看看是什么原因吗?非常感谢!

Error using fileparts
Too many output arguments.
 
Error in cfg_util>local_initapps (line 1144)

负性功能连接的结果分析

 各位老师大家好:
       我对OCD病人进行治疗前后的功能连接分析,发现OCD患者症状改善后,PFC与ACC之间负性功能连接结果增强,而且这个增强的负性功能连接与临床症状的改变呈负相关。想请教各位老师,对这样的结果应该从哪些方面进行解释?

关于统计分析的几个问题

 各位老师好,rest-fmri前期工作已经做完,现在我正进行统计分析,现将遇到的几个问题发到论坛上,希望能得到各位老师的帮助。谢谢。
1.关于cluster报告的问题:一个大体素怎么报告?我看到论坛上说报告中间的一部分,现在我就是不知道到底哪些要报哪些不要报,很泛的区域不报这个比较好理解,但是还是有很多小的区域啊,具体判断标准是什么?如P值选0.01,是不是voxels>16的都要报?如P值选0.05,是不是voxels>54的都要报?还有,cluster的MNI坐标在脑外要怎么报。。。如下:Cluster 1

Number of voxels: 4047