July 2016

使用dparsf for monkey 版本处理猴子的脑数据,如何进行reorient

老师,您好!

我目前正在使用dparsf 4.0 for monkey data 版本处理静息态猴子脑数据,采用的参数设置如下(事先已经去除了前6个时间点):

图1 参数设置

 

关于dpabi进行alphasim报错

各位老师,大家好,我现在在使用dpabi进行alphasim校正的时候遇到一个问题,希望老师能予以解答。

基本信息如下:我将VBM处理之后的SPMT图导入之后,选择重采样之后的mask文件,估计了平滑核等参数,然后iteration选择默认的1000,p选择了0.05,出现如下报错信息,如果p为0.01的话则可以顺利进行。

还有一个问题就是,在这种情况下,可以不可以使用p为0.01的这个文件看p为0.05的时候的voxels填入xjview等软件进行结果的查看?

用rest做统计分析

你好!看到有人用rest做统计分析时,先做两组被试的单样本T检验,得到的显著区域做并集mask,在这个mask下进行双样本T检验。如果是在全脑做的双样本T检验,rest只产生一个T图,那么在做alphasim较正的时候,估计平滑核用什么mask呢,下面的mask要用AAL模板吗?可是有人说估计平滑核的mask和下面的mask要用相同的,用spm可以产生mask,但是rest没有生成相关文件该怎么办呢?谢谢!

How to edit AAL template region

Hi all,

请教关于SPM8做双因素析因设计方差分析

老师:

      您好。我想请教一下您关于SPM8做双因素析因设计方差分析,希望您能在百忙中抽空回复。我想分析一下疾病诊断ZD(正常人,焦虑患者)的脑皮层灰质密度与基因型JY(危险基因位点,正常基因位点)的关系。我之前在网上找了很多资料,都没有办法解决疑问。

      我分析的过程是:首先要分析的图像是经分割并平滑后图像,SPM8中选specify 2nd-level,参数如下:

VBM统计分析 报错。

vmhc疑问

想请问一下,rest做vmhc可以采用default mask吗?我看很多文献好像是要自己制作模板。由于不是原始数据,不能制作模板,可以做vmhc吗?

关于VBM分析结果的校正

大家好,最近在学习VBM分析,好多文献在报告结果的时候都写的是the cluster-level statistical threshold was set at P < 0.05 corrected with underlying voxel level of p < 0.001 at the non-stationary cluster correction,我只知道FWE,FDR,Alphasim这些

template 是不是就是mask?

有点糊涂了,是不是用imgcaculater做出来的就是template?

关于静息态数据功能连接的问题

各位老师好:

      我现在在做静息态数据的研究,先用freesurfer对数据进行处理,提取时间序列,导入matlab中,计算相关系数,进行Fisher‘z变换,如何将数据导入图像中变到标准图像中去呢?谢谢!