如何从spm统计图筛选信息做报告

Submitted by chenlele on Sun, 09/04/2011 - 22:05

老师请问您个问题，如何从volume图找出有意义的坐标做报告，这张图太诡异了，NaN有意义吗，如果报告激活区，那些是有用的点，谢谢

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Submitted by YAN Chao-Gan on Thu, 09/08/2011 - 04:54

Nan表示团块水平不显著？我平常用AlphaSim多一些。你通常需要报告团块峰值点的值和坐标。
Part 2 of Course介绍了比较多这方面的内容，请参考。http://www.restfmri.net/forum/Course

Submitted by chenlele on Thu, 09/08/2011 - 09:06

谢谢老师，我后来用了同样的数据和参数在spm8里做，results用spm5（因为spm8没有FDR校正）结果显示了之前NaN的那一列值现在全部有数值值显示了，请问我的这种做法可行吗？
另外还想请教老师两个问题，来个文献的一句话：“We sought to control for effects from mis-registrations first by using FA = 0.15 as lower threshold to avoid voxels in primarily CSF or grey matter regions and second by using only voxels that all subjects had in common”
这里的first步骤是不是直接在spm里做Specify 2nd-level时直接作为 Threshold masking的Absolute threshold 的参数填进去就好呢？不同人的说话不太一样我都搞晕了。
然后second步骤是不是可以在IMCalc做个mask，然后作为Specify 2nd-level的explicit mask的参数文件图像呢？
可是我把所有被试的fa图照相乘后（expression: i1.*i2.*i3.*i4.*i5.*···.*i20)，之后我就display这个mask，结果是图像大部分都是黑色的，只要一小簇有点白，所以现在都不知道怎么处理

Submitted by ZHANG_RESTadmin on Sat, 09/10/2011 - 12:26

我看了你的r.jpg的图，图下面的字显示你在数据处理时设置的似乎有问题。
1. 平滑是用的FWHM怎么是 0 0 0？ 正常情况下这个数应该大于voxel size
2. resel怎么数目非常非常大？而且resel的大小怎么只有0. 正常情况下这个数应该小于voxel number

我想这是你得出NaN（非数）的原因。
请检查数据处理过程。

Submitted by chenlele on Sat, 09/10/2011 - 13:57

我采取了同样的参数设置后，在spm8里面计算出来的结果显示这一行有值了这里不好贴图，这里的帖子有图，http://52brain.com/read-htm-tid-14263-fpage-1-page-1.html
因为是DTI数据，本来voxel大小为1.8*1.8*3，normalize时是writting options的voxel size 设置为2*2*2，所以平滑时的FWHM设置为4，就不知为什么不是显示4了