Submitted by y.kong on Wed, 10/12/2011 - 06:16
有个比较弱的问题，刚没想明白，来问一下专家。
我用FSL写了个SCRIPT做ALFF，不过对ALFF有个问题。FSL对raw data做预处理的时候，会把图像的中间值global normalize到10000左右 － the whole 4D data set is normalised by a single scaling factor ("grand mean scaling") 。这样到higher level的统计才正确。但是这样的问题是每个SUBJECT SCALE FACTOR不同，再进行FFT计算ALFF的时候，会对结果有所影响。那在REST里面怎么处理normalisation的问题的？
谢谢
Submitted by ZangYF on Wed, 10/12/2011 - 10:24 Permalink
我认为，这种scaling只是标准化的方法之一。另一种是r
我认为，这种scaling只是标准化的方法之一。另一种是remove global mean time course，我猜测，这两种方法可能也有所不同。REST中，对ALFF的标准化放在后面，即除以全脑平均ALFF。这些方法之间到底有哪些差异、甚至哪个好哪个不好，还没有详细的研究说明这个问题。
Submitted by y.kong on Wed, 10/12/2011 - 23:49 Permalink
我有两组resting
我有两组resting state数据，比较alff的结果是第一组全脑到处都小。。。我估计就是normalisation的问题。FSL scale是以median value为准。两组数据估计scale的程度就不同。我对ALFF最后也除了全脑平均。应该回到最初原始数据做ALFF吗
Submitted by ZangYF on Thu, 10/13/2011 - 13:24 Permalink
Re: scaling
如果除以全脑平均ALFF，不应该出现全脑各位部位都低的情况呀。或许有必要好好比较一下不同standardization方法之间的差异。