单样本T检验出问题

Submitted by stevenlee697 on Wed, 02/15/2012 - 21:39

又来麻烦各位老师了。
我做了一下正常对照组的FC单样本T检验，发现正连接图激活面积很大，包括了默认网络脑区，不知道是哪出了问题，是不是方法上有问题？谢谢。
(我选了后扣带回的直径6MM小球作为种子区，VOXEL WISE，去除四个协变量，单样本T检验后在rest SLICE VIEWER中处理，ALPHASIM校正，RMM=5，P=0.05)
XJVIEWER显示结果只有一个大CLUSTER，有一万四千多VOXELS（共28个CLUSTER）其它是几或几十，大部分是十以下。
附件中有图

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Submitted by stevenlee697 on Fri, 02/17/2012 - 22:36

谢谢臧老师，我用GE自带的VIEWER软件查看了所有被试（24个）的图像、时间序列，没有发现问题。请问臧老师出现此问题还会是哪出了毛病？？谢谢。

Submitted by YAN Chao-Gan on Sat, 02/18/2012 - 00:30

去除四个协变量，是指什么？团块看起来是有点大。
如果没有去global，全脑的正连接都会很强。

Submitted by stevenlee697 on Sun, 02/19/2012 - 20:30

我是严格按照严老师视频讲解一步一步操作的。DPARSF中，“去除头动、全脑、白质和脑脊液四个协变量后”，选取SEED，后点FC，运算的。前面的步骤也没问题。这是怎么回事呢？？

Submitted by ZangYF on Sun, 02/19/2012 - 21:55

从图上看，的确看不到负相关。如果加了全脑平均时间序列，负相关总是应该能看到的，而这个图似乎只有one-tail或one-sided的结果（只显示正）。至于cluster 体积太大的问题，用较小的p值即可。

Submitted by stevenlee697 on Tue, 02/21/2012 - 23:57

谢谢臧老师，您说的对，我点了只显示正连接按钮。不过，在原来参数不变的情况下，我缩小了P值，P=0.01、P=0.001，正连接图变化不大，如“单样本T检验出问题2”附件内图所示（第一、二幅为P=0.01，第三、四幅为P=0.001），这是为什么？另外，原来用FDR可以校正，现在不知道为什么不行了，显示FDR only take effects on the statistical map，这又是为什么？谢谢。（这里不让传图，只能再开一个TOPIC“单样本T检验出问题2”）

Submitted by YAN Chao-Gan on Wed, 02/22/2012 - 23:38

我的观点：图总体看起来pattern还是有的，只是相对较怪一些。如果不校正的话，选P<0.001正负都显示一下，看看pattern?
“FDR only take effects on the statistical map”，表明你的图像不是用REST或SPM做的统计，里面没有自由度信息，请再检查或重做一下。

Submitted by stevenlee697 on Mon, 02/27/2012 - 22:46

严老师好，感谢你的帮助。
我重新做了一下正常组的ONE SAMPLE T TEST，FDR就可以做了，有结果。
我在不校正的情况下，做了P<0.001，有结果。
又直接在SLICE VIEWER中将T值分别改成100、150、250后，发现PATTERN有了样子，您看看。这是怎么回事，是不是计算的问题？？谢谢。
结果图在“单样本T检验出问题3”中，
第一、二图为P<0.001
第三、四图为FDR P<0.05
第五、六图为T=100
第七、八图为T=150
第九、十图为T=250

Submitted by YAN Chao-Gan on Mon, 02/27/2012 - 23:55

总的来说，相对很强。
你有多少被试?
另外，建议试试别的dataset对比一下。