DPARSF用DARTEL配准时报错

Submitted by yuanbinke on Fri, 02/17/2012 - 16:20

严老师：
您好!我在用DPARSF处理数据时，选择DARTEL配准方法，报如下错误：
The following modules did not run:
Failed: Run DARTEL (create Templates)

??? Error using ==> cfg_util at 808
Job execution failed. The full log of this run can be found in MATLAB command window, starting with the
lines (look for the line showing the exact #job as displayed in this error message)
------------------
Running job #1
------------------

Error in ==> spm_jobman at 206

Error in ==> DPARSF_run at 755

Error in ==> DPARSF>pushbuttonRun_Callback at 976

Error in ==> gui_mainfcn at 96

Error in ==> DPARSF at 43

??? Error while evaluating uicontrol Callback

这是我第一次使用DPARSF里的DARTEL配准方法，以前用DPARSF跑这批数据，使用另外两种配准方法是没问题的。
另外：DPARSF里的DARTEL配准方法默认的是自制模板吗？

AttachmentSize
Image icon dparsfa-dartel选项界面.jpg157.27 KB

Submitted by YAN Chao-Gan on Sat, 02/18/2012 - 00:12

看一下同上一个贴子是不是能一样解决？

DARTEL会生成一个组的template，DPARSF 2.1 的release note里面说了详细步骤，操作同SPM8 manual。

Submitted by yuanbinke on Sat, 02/18/2012 - 21:15

谢谢严老师的及时回复。
按照你在帖子“DPARSFA新版跑Dartel出错”中的建议，即“对于SPM，add with subfolders;对于REST和DPARSF，不要add with subfolders，只add folder”,上面的错误不再发生，但是做完“Normalize To MNI Space”后又报了如下错误，请你看看是怎么回事：
Done
'Normalise to MNI Space'
Done

??? Error using ==> movefile

mv: cannot stat `/home/ccbd002/yuan/DATA/data_eceo/FunImg/sub1/wra*': No such
file or directory

Error in ==> DPARSF_run at 848

movefile('wra*',['..',filesep,'..',filesep,'FunImgNormalized',filesep,AutoDataProcessParameter.SubjectID{i}])

Error in ==> DPARSF>pushbuttonRun_Callback at 976

[Error]=DPARSF_run(handles.Cfg);

Error in ==> gui_mainfcn at 96

feval(varargin{:});

Error in ==> DPARSF at 43

gui_mainfcn(gui_State, varargin{:});

??? Error while evaluating uicontrol Callback

Submitted by YAN Chao-Gan on Sun, 02/19/2012 - 08:14

我猜测你在Slice timing->Realign->Normalize之间跳了步。
如果是这样的话，建议你使用DPARSFA而不是DPARSF basic edition，basic edition操作更简单但是比较缺乏灵活性。

Submitted by yuanbinke on Sun, 02/26/2012 - 14:44

严老师：
按照你的建议，我用DPARSFA来跑这批功能数据，选择DARTEL做配准方法，不过依然是报错：
Done 'Normalise to MNI Space'
Done

??? Error using ==> movefile
No matching files were found.

Error in ==> DPARSFA_run at 1317
movefile('w*',['..',filesep,'..',filesep,FunSessionPrefixSet{iFunSession},AutoDataProcessParameter.StartingDirName,'W',filesep,AutoDataProcessParameter.SubjectID{i}])

Error in ==> DPARSFA>pushbuttonRun_Callback at 1133
[Error]=DPARSFA_run(handles.Cfg);

Error in ==> gui_mainfcn at 96
feval(varargin{:});

Error in ==> DPARSFA at 31
gui_mainfcn(gui_State, varargin{:});

??? Error while evaluating uicontrol Callback

这个错误是说找不到对应的‘wra’文件。是这样吗?
后来我用SPM来作预处理，用SPM DARTEL TOOLBOX 做功能数据配准这一步。按照SPM-manual里的步骤，即1：initial import.2:run DARTEL -creat template.3:normalzie to MNI space.其中第三步输入的是头动校正后的功能像。结果是直接得到了“swra...”文件。我想问：这样得到结果是不是正确的，是不是可以直接（平滑或者不平滑）后处理了。

Submitted by YAN Chao-Gan on Mon, 02/27/2012 - 23:53

把你的DPARSFA中的设置贴一下。看起来有步骤不太对劲。
swra已经由DARTEL平滑过了。

Submitted by YAN Chao-Gan on Wed, 02/29/2012 - 03:35

按照你的设置，应该不会报告找不到w*的问题。
你检查一下DPARSFA执行到这一步的时候，FunImgAR下面都有些什么文件。