Submitted by demonpupil on Tue, 02/28/2012 - 19:57
各位老师好:
请教老师两组问题,1.假设在做功能连接时,甲组患者体素A与ROI的功能连接r是-1,乙组患者体素A与ROI几乎没有什么联系,r为-0.1,那么甲组与乙组进行双样本T检验得到相对于乙组甲组A体素与ROI的功能连接为-0.9,这个-0.9能否证明甲组A体素与ROI的连接较乙组有减弱呢?
2.我看到有的文章中的colorbar标注的是T值,有些标注的是Z值(2010_Spatial Patterns of Intrinsic Brain Activity in Mild Cognitive Impairment and Alzheimer’s Disease A Resting-State Functional MRI Study),还有的既标注了T又标注了Z(Effects of aging on default mode network activity in resting state fMRI: Does the method of analysis matter?如附件中的图),问题是利用REST的statistic工具进行单样本,双样本,方差分析以及相关性分析出来的图中的colorbar应该是标T呢还是标Z呢?(我们是对DPARSF算出的mfALFF进行计算,同时还进行了ROI Wise的功能连接)?有的论文中在报表格时既标了peak点的t值又标了peak点的z值,那么一定有什么东西可以进行这两种值的转换,那么利用什么工具可以知道一个t值对应的z值是多少呢?记得在做FC的时候会出现一个FisherZ变换,是否在比较组间FC的时候得到的图必须要标注Z值?
Attachment | Size |
---|---|
bmp. | 810.99 KB |
Submitted by ZangYF on Tue, 02/28/2012 - 20:38 Permalink
Re: FC between two groups
这是一个很普遍、很有意思的问题。这种情况下,通常会说B组没有显著的functional connectivity (FC),而A组有显著的anti-correlation。不管A或B是患者组,只要是病人,就说不正常。具体解释要看情况。
Submitted by demonpupil on Wed, 02/29/2012 - 10:34 Permalink
Re
谢谢臧老师!!
Submitted by YAN Chao-Gan on Wed, 02/29/2012 - 03:44 Permalink
Re
OK, 问题2:
如果你是用REST统计模块做的双样本T检验,自然要标T,不能标Z。
每一个T值都有一个对应的Z值,他们有相同的显著性P,但Z值里面就去除了自由度的信息。
比如说,你如果有20个被试,得到T=3,和你有2000个被试,得到T=3在显著性上是不等价的。
如果你用Z值,由于去除了自由度信息(即20与2000的差别),那么可以等价比较。
我以前写过一个将T/F/R转为Z的程序,见http://www.restfmri.net/forum/Programs_YAN
1. Program for converting T/F/R statistical image to Z statistical image. y_TFRtoZ.m
下一版REST会加入类似FSL的easythresh的多重比较校正,鉴于FSL是基于Z图估计自由度,我们也准备把这个转换整合进REST里面去。
Submitted by demonpupil on Wed, 02/29/2012 - 10:35 Permalink
Re
谢谢严老师,期待下一版本,哈哈!