请教关于双样本T检验的MASK的问题

Submitted by liwenfu on Mon, 04/23/2012 - 10:28

我的静息态实验有两个组，A和B，先给A、B组在REST软件中分别做了一个单样本T检验，此时没有选择MASK，然后用Slice Viewer分别打开这两个组的单样本T检验结果，使用Alphasim（0.05）矫正，Cluster个数选择的是324，我现在为了得到双样本T检验的MASK，是将正负激活的Clusters都保存下来还是只保存Only+啊，这两种有没有区别啊，我计算MASK时的表达式是“(i1>0+i2>0)>0”.

Submitted by juefirst on Mon, 04/23/2012 - 12:02

首先，静息态没有激活，没有“激”，就不存在“激活”，我们称为之活动。
单样本T检验结果校正时的voxel数324从何而来？是否Slice Viewer中给出的？
双样本T检验为什么要用MASK？你想看什么？用什么MASK取决于你想要看什么。
从某一结果中保存MASK时正负都保留和只保留正有没有区别也取决于你使用的结果，如果结果中有正有负，当然跟只保留正就是有区别的。

软件是我们实现目标的手段，我们第一步应该先明确目标。

Submitted by liwenfu on Mon, 04/23/2012 - 12:37

我实验的目的就是考察高低创造性被试的静息状态是否有差异，高低创造性是用量表测得的，我准备用ALFF的指标，先做两组的单样本T检验，然后再做双样本T检验。
单样本T检验结果矫正是在Slice Viewer中进行的，由于我的平滑核使用的是[8 8 8 ]，我设置的Alphasim矫正的p值是.05，然后我选择的rmm是4，所有个数是324
我看视频教程里面说，可以用两组的单样本T检验矫正后的图做并集做为双样本T检验的MASK，

Submitted by juefirst on Mon, 04/23/2012 - 13:50

可以使用两组单样本并集作双样本的MASK.
如果你想考察高低创造性被试ALFF的差异,保存MASK时建议正负都保留,最大限度观测到差异.
制作MASK有个虽然笨但肯定不出错的方法告诉你,save clusters,然后在calculator里自己除以自己,即i1./i1,两幅单样本图都这样处理,相加之后再除以自己.

Submitted by liwenfu on Mon, 04/23/2012 - 19:27

我将两个组的单样本T检验在Slice Viewer中调整好阈值，用Alphasim矫正后，点击save clusters，保存后，用SPM中的Image Calculator制作的MASK，首先选择刚刚保存的两组的单样本T检验的图，然后表达式是“(i1>0+i2>0)>0”,得到一个MASK，然后将这个MASK用到双样本T检验中。不知道这种方法行不行，和你说的这种有什么差异，谢谢。

Submitted by YAN Chao-Gan on Mon, 04/23/2012 - 23:05

 注意一下有这样的一个concern: http://www.restfmri.net/forum/node/764#comment-1235

如果你不关心在任意一组都不显著的体素（当然有时候两组都不显著的体素也会存在组间差异，并且这种差异有可能是有意义的！）：
也许双样本T检验的校正还是应该在全脑范围内校正，但报告和显示结果在one sample t-test 的MASK内。

Submitted by liwenfu on Tue, 04/24/2012 - 13:16

是不是说我如果只关注两组差异的地方，在做双样本T检验的时候就可以不用选择MASK，只是在报告和显示结果的时候再使用单样本T检验的MASK？这个功能是不是用Imge Calculator进行，表达式应该怎么写？谢谢老师