SPM中图像方向调整问题

Submitted by ammahuifang on Thu, 05/31/2012 - 09:26

 针对图像的旋转，以及如何让图像在SPM中正常显示时，符合SPM中template中T1模板的方向，据了解，SPM中nii格式图像显示是右对左，左对右。期待您在百忙之中能给我一些指点。

Warning：This NIfTI image includes an rotation transformation.You should reslice this data before attempting to underlay the image



Submitted by ZHANG_RESTadmin on Thu, 05/31/2012 - 09:55

  1. nifti格式的数据本身包含了能够识别左右的信息，你用SPM5及以上版本处理数据，以及用MRIcron看数据的时候，就能够保持左右信息。
  2. SPM中是左是右右是左的形式，如果用spm5或者8打开非nifti格式的数据则可能方向会出错。你需要用spm的display来调整。
  3. warning里的意思是让你先做reslice，再叠加到结构像上。因为你的图像被转过了。nifti头信息里包含了这个转动信息，但是你需要reslice。

Submitted by ammahuifang on Thu, 05/31/2012 - 10:18

如果原始图像是DICOM格式的，将DICOM转为img&hdr格式后，进行图像处理，处理完后，转入rest中slive view进行统计学结果分析，提示旋转信息，
请问1 从结构像上怎么区分左右脑，有没有明显不同区域可以用来区分的？
      2 将图像转为img&hdr后，再转为nii，一般有什么方法？我直接采用mricron进行转的，可以吗？
     
        

Submitted by YAN Chao-Gan on Fri, 06/01/2012 - 02:54

 这些IMG/HDR不是ANALYZE,因为带有旋转矩阵。
REST Slice Viewer不能正确处理带有旋转矩阵的图像，转完格式的数据是在原始空间，通常也应该是不带旋转的。
如果你要看原始空间而非MNI空间的图像，建议用MRIcroN来显示。