Submitted by wleewell on Thu, 07/26/2012 - 10:04
论坛老师们:
我用DPASRFA2.1版做功能连接前的预处理,做了slice timing、reliagnment、normalise(T1像)、detrend and filter,继续做了剔除头动、全脑平均、白质、脑脊液协变量后,发现图像变得怪怪的,主要有两个问题,一是所有volume在脑外也出现了信号,二是有部分volume图像整个都是灰灰的,如图。过程中文件夹都正常生成了,后面的功能连接图也跑的顺利。
我单跑了剔除头动或剔除全脑平均等,并且用rest软件试了下,换成spm5等等,还是这种情况,为什么输入软件推荐的步骤,出来的结果却很奇怪呢。后来发现spm qq群里有几个人都是类似的情况,所以很希望老师们帮忙分析下,是那里的问题?如果这一步可以纠正,我还是希望用DPARSFA做,毕竟简单快捷。另外建议老师们能上传下你们处理的中间数据的示意图,我们可以作为质量控制的标准。
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Submitted by wleewell on Thu, 07/26/2012 - 11:20 Permalink
问题已经解决,谢谢论坛老师们!
问题已经解决,谢谢论坛老师们!
Submitted by YAN Chao-Gan on Wed, 08/01/2012 - 23:23 Permalink
Re
解释一下为什么回归之后你会看见这样的图像。在做回归之前,脑内的信号是远高于脑外的,所以你在图像上可以看见清晰的脑内脑外差别。同理,灰质白质脑脊液三者的BOLD信号强度也是不一样的,所以在回归之前,你能够很清楚地看到大脑的图像。然而,在做回归的时候,不仅会去掉头动、白质…等等协变量信号,“时域均值”也同时去除掉了。所以这个时候,脑内信号和脑外信号的“时域均值”都被去掉了,你不会再看到脑内信号非常明显地高于脑外信号。同样,灰质白质之间的差别也相应被取消掉了,因为这个时候你看见的只是变异,已经没有时域均值了。当然,由于脑外信号大都是一些随机噪声,所以你会看见脑外的信号弱且随机性强。时域均值的去除与否,都不影响后面的频域分析(如ALFF)或相关分析(如功能连接或类似看相似性的ReHo)。