ICA的问题+DPARSF

Submitted by Chen0075 on Tue, 08/14/2012 - 21:30

各位老师：
请问一个ICA的问题：有3组subjects的静息态数据，其中2组同时采了follow-up的data；请问面对这样的“5组”数据时，ICA是否适用（比如分离DMN）。如果适用，那么成分数怎么定，是把全部“5组”的subjects都放进去做估计吗（但是其实真实的人只有3组！）。
另外：我用DPARSF的“extract AAL time course （90 regions）”的方法，提取了90个脑区的时间序列，然后我想做90个脑区之间的两两相关（90×89/2），应该怎么做呢，可以用REST做吗？
谢谢！

Submitted by YAN Chao-Gan on Thu, 08/16/2012 - 02:06

问题1应该是张寒更专业一些。

问题2：

可以用以下命令得到。下一个版本我再简化一下。

theROITimeCourses=[];

for iAAL=1:90

    AreaName=['0',num2str(iAAL)];

    AreaName=AreaName(end-1:end);

    eval(['theROITimeCourses=[theROITimeCourses,AAL',AreaName,'TC];']);

end

 

R_Matrix = corrcoef(theROITimeCourses);

Submitted by ZHANG_RESTadmin on Thu, 08/16/2012 - 11:31

ICA对多组数据多session数据是适合用的。你需要把所有组所有人的数据放在一起，输入ICA，让ICA统一计算得到结果。
得到每个人的结果后，你可以根据不同组别进行相应分析如ANOVA或者双样本t检验。
前提是你要把被试输入顺序记好，这样最后每个数据表示哪个subject，哪个group，哪个session才不会搞错。