Submitted by 小黎 on Sun, 01/04/2009 - 11:57
本人做了一个resting state fmri 的实验,受试是人,受试者在用药前和用药后做一次磁共振扫描,数据分析采用ALFF分析,统计用配对T检验,但统计出来的图如附件所示,好象结果都跑到脑外去了,不知道为何会如此,请高手指点解决。不胜感激!
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本人做了一个resting state fmri 的实验,受试是人,受试者在用药前和用药后做一次磁共振扫描,数据分析采用ALFF分析,统计用配对T检验,但统计出来的图如附件所示,好象结果都跑到脑外去了,不知道为何会如此,请高手指点解决。不胜感激!
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Submitted by YAN Chao-Gan on Mon, 01/05/2009 - 11:24 Permalink
Re: 求助
您好!
看起来,似乎你的数据没有配准,要不先检查检查你的预处理过程?具体操作可以参考视频:http://pub.restfmri.net/Anonymous/Data_Process_of_Rest_fMRI.mp4
Submitted by 小黎 on Mon, 01/05/2009 - 16:23 Permalink
求助
严老师:
您好!我做预处理和ALFF的步骤都是按照视频上所教,预处理用spm5,ALFF用的就是你们提供的rest软件,是在本网站下载的。处理了两遍,还是这个结果,不知道为什么。请您再分析分析是怎么回事。谢谢!
Submitted by admin on Mon, 01/05/2009 - 21:23 Permalink
你的数据处理过程描述的过于简略
一般而言,做出正确的结果只有一种途径,出现错误的结果的方式却可以千差万别,所以为了解决你自己的问题,哪怕一步一图呢,虽然稍微麻烦点儿,但那样肯定能帮助大家来发现你处理数据时的问题。
Submitted by YAN Chao-Gan on Tue, 01/06/2009 - 10:51 Permalink
Re: 求助
您好!
晓伟说得非常好,把过程描述清楚才能分析到底是哪一步出的问题。
或者,你也可以试图用回推法来看是哪一步出的问题。比如先看看单样本T检验是不是也存在类似的问题,若也有问题,再一步步用MRIcroN去看你之前处理的中间文件,看在哪一步图像产生了偏移,这样就能找到问题的所在。祝顺利!
Submitted by 小黎 on Wed, 01/07/2009 - 12:37 Permalink
求助
严老师:
您好!按照你提供的回推法查找问题,我发现单样本T检验也是存在类似的问题,用MRIcon去看之前处理的中间文件,却发现ALFF处理后的mALFFMap文件是打不开的,做detrend和filtered后的结果文件还是能打开的(不好意思,我不懂得是如何看图象有没有偏移)。我现在最担心的是,会不会是采集到的数据有问题?请您指点。还有,严老师,可不可以留下你的邮箱地址或是其它通讯方式,我可以私下请教你。不胜感激。
Submitted by YAN Chao-Gan on Wed, 01/07/2009 - 22:51 Permalink
Re: 求助
你好!
你说mALFF map打不开,可能你的MRIcroN有问题,请你google一下MRIcroN去下载一个最新版本,应该是可以打开的。
另外,你可以回去看你normalize后的数据是否有问题。总之一步步回去看,原始数据有问题也是有可能的,但通常这个可能性不大。
我觉得在这讨论也很好,大家都可以看到,你遇到的问题其他研究者可以借鉴,你觉得呢?我的邮箱: ycg.yan[at]gmail.com