计算ReHo结果中VOXEL数目

Submitted by wujingxi on Mon, 10/15/2012 - 21:00

大家好：
有没有好的方法或者软件包能计算一个cluster中灰质voxel的数目？或者有能用的程序段吗？
这个问题对我们的北京比较恼火 谢谢大家啦

Submitted by wujingxi on Wed, 10/24/2012 - 11:14

 谢谢指导 我按照指示做了 有两点不清楚
1. 这个功能需要设置Cluster Size，其中的set rmm value (connectivity Criterion)我猜想是指cluster中体素连接的方式，surface/edge/corner connected分别指的是什么？一般大家都用那种呢？
2.报道的cluster size中我看还有white matter的数目，在文章中报道的时候需要剪掉白质的个数吗？CSF的情况呢？

谢谢

Submitted by jigongjun on Wed, 10/24/2012 - 17:43

1. 这个功能需要设置Cluster Size，其中的set rmm value (connectivity Criterion)我猜想是指cluster中体素连接的方式，surface/edge/corner connected分别指的是什么？一般大家都用那种呢？
    surface/edge/corner connected分别表示两个立方体（voxel）只要有一个面或边或角是共用的，那么就认为这两个体素是连接着的。这几种连接方式你都是可以选择的，当然面连接是最严格的标准。

2.报道的cluster size中我看还有white matter的数目，在文章中报道的时候需要剪掉白质的个数吗？CSF的情况呢？
    报告时报的应该是每个cluster内的voxel总数，不必将落在白质的剔除。如果你有整个cluster落在白质或CSF的情况，可以考虑在分析时用灰质模板做mask。