关于Alphasim的问题

老师:
      您好。我用VBM比较两组被试灰质差异,想用Alphasim进行校正。标准化后得到的图像voxel size为1*1*1。我有以下几个问题:

     1、在用REST Alphasim计算时,mask应该用全脑的还是用灰质的?

      2、如果选择灰质mask,是不是可以用spm/apriori中的灰质图,然后用rest中的image calculator,设定i1>0.2, 得到灰质mask后再重采样成1*1*1,这样制成的灰质mask是正确的吗?假如我做白质的分析,白质mask是不是可以直接对rest中提供的WhiteMask_09_61*73*61进行重采样?

      3、在REST Alphasim计算时,由于voxel size为1*1*1,那么rmm是不是可以选择2?

请老师指教,谢谢!

Hi!

1. 取决于你的假设,如果你只关心灰质变化,可以采用灰质MASK。如果你白质区域和CSF区域也关心的话,可能需要采用全脑MASK。
2. 可以何用spm/apriori中的灰质图。但鉴于你已经做了VBM,另一种可行的途径是,取A组灰质平均图,卡0.2. 再取B组灰质平均图,卡0.2。得到两个图之后再取并集,做为MASK。白质MASK类似,但要注意的事,除非你的特别的假设,否则不能第一步在灰质里面校正,第二步在白质里面校正。不然,需要进行两者的多重比较校正。
3. 可以,这意味着是最宽松的角连接(26个邻居)。

谢谢老师的回复!
如果我用spm/apriori的灰质图,需要卡0.2吗?得到MASK后再用Alphasim计算某个阈限上(如0.01)校正的cluster size,是不是?
我是白质和灰质分别做了VBM分析,可以分别校正吧?

如果非要使用spm的先验概率图的,也应该卡阈值。如果不卡阈值,那么所有体素都进入了。
是的。
你是指分别对白质图像和灰质图像进行了统计分析?虽然也有多重比较校正的问题,但一般能够接受分别进行校正。