Submitted by 287391600 on Thu, 11/15/2012 - 22:12 老师: 您好! 请教老师这样的问题:我之前用的是种子点的功能连接方法,得出病人组和正常组差别不大,但是后来我改用ICA的方法得出的结果是病人组的有比较明显的减弱的区域,所以这两种方法的结果有矛盾的地方,这让我该怎么往下进行呢? 谢谢! Log in or register to post comments 9801 reads Submitted by YAN Chao-Gan on Fri, 11/16/2012 - 03:05 Permalink Re: 关于ICA和种子点的方法 ICA与种子点的功能连接方法,得到的功能连接图并不完全等价。 即使同样说是默认网络,种子点方法存在如何定义seed的问题。而ICA也存在确定成份数(成份数多的情况下DMN会分成几个子成份)以及如何确定某一成份为DMN的问题。所以可能会得到不一致的结果。当然,从ICA的角度出发,有一种解释认为较好地排除了其他噪声成份的影响,这有可能会是造成你目前结果的原因。 张寒可能会从ICA的角度给出更进一步的解释。 Log in or register to post comments Submitted by haohaoxuexi on Fri, 11/16/2012 - 23:10 Permalink Re: 关于ICA和种子点的方法 老师们, 你们好! 我也想分析一下我的病人的DMN改变情况。可我没学过,不知道怎么实现ICA,我会种子点的方法。那我想知道的是,是不是我们要先做一个DMN的MASK,然后再在这个MASK中去看其各组分的活动,然后做功能连接。做功能连接的时候,就可以用种子点的方法或是ICA的方法,我的理解是对的吗?请高人指点。如果是对的,那我怎样做这个MASK呢,REST中有方法,还可以查文献。不过文章里没人说怎么做的。或者是我还没看明白。请老师帮忙指条明路。 谢谢您的时间。 Xue Log in or register to post comments Submitted by ZHANG_RESTadmin on Mon, 11/19/2012 - 11:25 Permalink Re: 关于ICA和种子点的方法 ICA是基于全脑计算得到的。不需要做ROI 或者 mask。 有关文献,你可以参考Greicius 2003, 2004,以及后续的一系列用ICA结合默认网络做疾病的研究。 Log in or register to post comments Submitted by ZHANG_RESTadmin on Fri, 11/16/2012 - 18:02 Permalink Re: 关于ICA和种子点的方法 严老师说的没错,ICA结果和种子点相关结果不一致是很正常的。 首先这是两种不同的方法,得到的结果的意义也是不同的,虽然有人都叫做resting-state funtional connectivity. ICA是基于高阶统计量计算的,考虑了更多的信息,但是存在结果难以理解的问题。 种子点相关这个方法非常straightforward,是Karl Friston提出的functional connectivity概念的一种很自然的实现形式,它只考虑二阶统计量。 目前这两种方法都是主流,你用哪个都行。你可以用病人减弱的地方和行为量表相关,看看是否可以有相关,这样解释起来容易,让人也更容易信服你的结果。 Log in or register to post comments
Submitted by YAN Chao-Gan on Fri, 11/16/2012 - 03:05 Permalink Re: 关于ICA和种子点的方法 ICA与种子点的功能连接方法,得到的功能连接图并不完全等价。 即使同样说是默认网络,种子点方法存在如何定义seed的问题。而ICA也存在确定成份数(成份数多的情况下DMN会分成几个子成份)以及如何确定某一成份为DMN的问题。所以可能会得到不一致的结果。当然,从ICA的角度出发,有一种解释认为较好地排除了其他噪声成份的影响,这有可能会是造成你目前结果的原因。 张寒可能会从ICA的角度给出更进一步的解释。 Log in or register to post comments
Submitted by haohaoxuexi on Fri, 11/16/2012 - 23:10 Permalink Re: 关于ICA和种子点的方法 老师们, 你们好! 我也想分析一下我的病人的DMN改变情况。可我没学过,不知道怎么实现ICA,我会种子点的方法。那我想知道的是,是不是我们要先做一个DMN的MASK,然后再在这个MASK中去看其各组分的活动,然后做功能连接。做功能连接的时候,就可以用种子点的方法或是ICA的方法,我的理解是对的吗?请高人指点。如果是对的,那我怎样做这个MASK呢,REST中有方法,还可以查文献。不过文章里没人说怎么做的。或者是我还没看明白。请老师帮忙指条明路。 谢谢您的时间。 Xue Log in or register to post comments
Submitted by ZHANG_RESTadmin on Mon, 11/19/2012 - 11:25 Permalink Re: 关于ICA和种子点的方法 ICA是基于全脑计算得到的。不需要做ROI 或者 mask。 有关文献,你可以参考Greicius 2003, 2004,以及后续的一系列用ICA结合默认网络做疾病的研究。 Log in or register to post comments
Submitted by ZHANG_RESTadmin on Fri, 11/16/2012 - 18:02 Permalink Re: 关于ICA和种子点的方法 严老师说的没错,ICA结果和种子点相关结果不一致是很正常的。 首先这是两种不同的方法,得到的结果的意义也是不同的,虽然有人都叫做resting-state funtional connectivity. ICA是基于高阶统计量计算的,考虑了更多的信息,但是存在结果难以理解的问题。 种子点相关这个方法非常straightforward,是Karl Friston提出的functional connectivity概念的一种很自然的实现形式,它只考虑二阶统计量。 目前这两种方法都是主流,你用哪个都行。你可以用病人减弱的地方和行为量表相关,看看是否可以有相关,这样解释起来容易,让人也更容易信服你的结果。 Log in or register to post comments
Submitted by YAN Chao-Gan on Fri, 11/16/2012 - 03:05 Permalink
Re: 关于ICA和种子点的方法
ICA与种子点的功能连接方法,得到的功能连接图并不完全等价。
即使同样说是默认网络,种子点方法存在如何定义seed的问题。而ICA也存在确定成份数(成份数多的情况下DMN会分成几个子成份)以及如何确定某一成份为DMN的问题。所以可能会得到不一致的结果。当然,从ICA的角度出发,有一种解释认为较好地排除了其他噪声成份的影响,这有可能会是造成你目前结果的原因。
张寒可能会从ICA的角度给出更进一步的解释。
Submitted by haohaoxuexi on Fri, 11/16/2012 - 23:10 Permalink
Re: 关于ICA和种子点的方法
老师们,
你们好!
我也想分析一下我的病人的DMN改变情况。可我没学过,不知道怎么实现ICA,我会种子点的方法。那我想知道的是,是不是我们要先做一个DMN的MASK,然后再在这个MASK中去看其各组分的活动,然后做功能连接。做功能连接的时候,就可以用种子点的方法或是ICA的方法,我的理解是对的吗?请高人指点。如果是对的,那我怎样做这个MASK呢,REST中有方法,还可以查文献。不过文章里没人说怎么做的。或者是我还没看明白。请老师帮忙指条明路。
谢谢您的时间。
Xue
Submitted by ZHANG_RESTadmin on Mon, 11/19/2012 - 11:25 Permalink
Re: 关于ICA和种子点的方法
ICA是基于全脑计算得到的。不需要做ROI 或者 mask。
有关文献,你可以参考Greicius 2003, 2004,以及后续的一系列用ICA结合默认网络做疾病的研究。
Submitted by ZHANG_RESTadmin on Fri, 11/16/2012 - 18:02 Permalink
Re: 关于ICA和种子点的方法
严老师说的没错,ICA结果和种子点相关结果不一致是很正常的。
首先这是两种不同的方法,得到的结果的意义也是不同的,虽然有人都叫做resting-state funtional connectivity.
ICA是基于高阶统计量计算的,考虑了更多的信息,但是存在结果难以理解的问题。
种子点相关这个方法非常straightforward,是Karl Friston提出的functional connectivity概念的一种很自然的实现形式,它只考虑二阶统计量。
目前这两种方法都是主流,你用哪个都行。你可以用病人减弱的地方和行为量表相关,看看是否可以有相关,这样解释起来容易,让人也更容易信服你的结果。